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生物医学信息学浙江中医药大学信息技术学院王海舜课程学习目的和要求教学目的:通过本课程的学习,掌握医学信息学的基本原理,能用医学信息学的方法和计算机技术开展医学研究. 课程内容:医学信息学生物信息学课程的内容医学信息学基础医学信息标准化临床信息系统 医学信息有序化医学信息获取PACS系统及其实现医学信息的硬件架构和信息安全临床信息系统临床路径无线网络医学决策支持生物信息学概论生物数据库序列对比和数据库搜索课程教学目的和要求教学方法:理论课实验课医院信息化建设见习,调研讨论课考核办法综述,调研报告,实验报告40%教学参与情况(讨论课,上课参与)10%考试50%教材和参考书目教材:王伟.医学信息学.高等教育出版社,2006,2参考书目:(荷兰)J.H.Van Bemmel (美国)M.A.Musen 主编 包含飞 郑学侃 主译,医学信息学,上海科技出版社.傅征等,医院信息系统建设与应用,人民军医出版社,2003,3金新政等,医院信息系统,科学出版社, 2004.1黄晓鹂主编,医学信息学教程,中国科学技术出版社第一章 医学信息学基础第一节 医学信息信息的含义信息存在的普遍性信息概念的表述各家学说:归纳为五种主要学说国家标准(GB/T4894-1985):是事物变化和特征的反映;是事物间相互联系的表征;是事物在特定信息载体上的映射或再现信息的特征语法语义语用医学信息学(Medical Informatics)概念:医学信息是指医学,医疗卫生和公共健康或药学,药物为信息内容和应用领域的各种信息.传统的医学信息学--侧重文献信息管理,分析研究.现代医学信息学--计算机技术与IT应用到医药卫生领域.医学信息的要素:语义要素语用要素医学信息的类型根据存在方式分类人体内信息人体外信息根据来源分类系统内部信息系统外部信息根据应用领域分类医学研究信息临床研究信息医学市场信息医学管理信息第二节 医学信息学相关概念信息与数据数据基本单元---符号信息构成的基础---数据信息的外在形式---消息信息与知识知识的定义P9知识的分类知事类知识(know-what)知因类知识(know-why)知能类知识( know-how)知人类知识( know-what)知识与信息的关系信息与文献文献的概念:记录有信息和知识的一切载体.文献的等级结构.p12 图1-6一次文献二次文献三次文献文献与信息的关系 P13 图1-7信息与知识性记录性载体实体形态性第三节 医学信息学研究20世纪70年代末借用法语单词informatique medicale而来.将先前的医学计算机科学,医学信息科学,计算机医学应用卫生信息学等统一而成.1978年国际医学信息学会(IMIA)成立.是WHO认可的非政府组织.1974年起每3年一次会议.医学信息学的定义医学信息学是以信息学,信息管理和信息技术为依托,研究医学领域中的信息现象和信息规律,用于医学决策和管理的一门交叉学科.交叉学科与IT技术密切相关任务医学信息利用和共享,提高决策国外医学信息学的发展过程医学信息学的初期探索(20世纪60年代)MEDLARS的建成为标志美国大学生命科学计算机资源医学信息学的发展时期(20世纪70-80年代) 大规模医院信息系统国际医学信息学会成立(IMIA)医学信息学的深入研究时期(20世纪80年代中期至今)大型研究项目的开展从以数据处理的阶段进入知识处理的新阶段,医学人工智能和专家系统的研究为主要标志.二,我国医学信息学的发展进程1995年金卫工程建立国家医疗信息骨干网建立卫生宏观数据库建立医院HIS发行金卫卡军队一,二,三号工程1987年,中国医学信息学会(CMIA)成立.04年11月,中国卫生信息学会成立存在的问题:缺乏研究的深度和广度.医学信息学的研究对象和研究领域研究对象对生命信息现象的研究应用控制论 P15 图1-8对人类社会活动中医学信息的研究循证医学P16 图1-9诊断-治疗循环1.人类活动的三个阶段:观察,分析, 行动 2.医疗卫生活动:观察,诊断,治疗 观察,分析,行动诊断-治疗循环生物信息学(Bioinformatics)概念美国人类基因组计划实施五年后的总结报告中,对生物信息学作了以下定义:生物信息学是一门交叉科学,它包含了生物信息的获取,处理,存储,分发,分析和解释等在内的所有方面,它综合运用数学,计算机科学和生物学的各种工具,来阐明和理解大量数据所包含的生物学意义.生物信息学核心观点:生命现象是在信息控制下不同层
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