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大多数snoRNA由内含子编码 人类基因组中大多数snoRNA由内含子编码 1)rRNA前体每个被修饰的位点都有一个对应的不同的 snoRNA。根据修饰的位点推测,每个细胞必需有数百 个不同的snoRNA。 2)目前仅有极少数snoRNA基因被定位,估计只有少数 snoRNA分子是从标准的基因转录的,大部分成员可能 来自基因的内含子,经剪接后再释放出来。如U14-U24(除U22外)和U32-U40基因位于蛋白质编码基因的内 含子中, 而U22和U25-U31则位于一个编码RNA分子的 基因内,其产物也经RNA剪接释放sno URNA。 tRNA与细菌rRNA的修饰 1) 原核生物和真核生物tRNA的 修饰均由酶催化 2) 细菌rRNA的修饰由酶催化 以上的修饰不涉及其它RNA分子 mRNA编辑的类型 1) 碱基修饰,如将CAA转变为UAA. 2) 泛编辑(pan-editing), 在guide RNA指导下在mRNA分子内插入若干U. 3) 插入编辑, 在mRNA合成时插入碱基,改变读框. 4) 多聚A编辑,在mt mRNA尾部加上一连串A, 产生终止密码. mRNA碱基更换编辑 线粒体COXIII mRNA的编辑 泛编辑(pan editing):插入U 锥虫mt mRNA可通过不同的gRNA进行可变编辑. 脱脂蛋白apo-B mRNA的编辑 腺嘌呤脱氨基 果蝇para mRNA的编辑(a→g) 腺嘌呤脱氨基生成次黄嘌呤, 后者的化学特性类似鸟嘌呤. 果蝇para mRNA加工与修饰后的类型 1)果蝇para mRNA有1536种可变剪接; 2)para mRNA有11种RNA的编辑方式; 3)理论上para mRNA可产生1 032 192种顺 序不同的mRNA。 哺乳动物GluR mRNA的编辑 1)哺乳动物神经系统glutamate receptor subunit gene(GluR)基因为神经细胞跨膜蛋白,对神经传 递分子谷氨酸作出响应,在记忆与学习中起重要作 用.GluR可开通离子通道,启动神经脉冲。 2)GluR mRNA在转录后可由ADAR(adenosine deaminase edting on RNA)编辑,将A转变为I (inosine,次黄嘌呤)。 人类线粒体mRNA的编辑 1)人类线粒体 有13个mRNA,其 中5个mRNA均以U 或UA尾,无终止 密码; 2)通过编辑可 将U或UA转变为 UAAAA--,产生 终止密码UAA。 植物叶绿体与线粒体mRNA的编辑 1)叶绿体基因总数约150左右,烟草叶绿体基因 mRNA的编辑位点数约30个; 2)高等植物线粒体基因总数在60-90之间; 烟草线粒体基因mRNA的编辑位点超过400; 3)细胞器基因大多数的编辑为C→U; 4)叶绿体mRNA的编辑信号为-22nt-C-16nt-: -CUUAAUCCGAAUUAUAGAGCUA C GACACAAUC- 叶绿体mRNA编辑机制 核酸开关(riboswi-tch) 见:Science 306:233-234 , 2004. Nature 428:281-286, 2004.已报道 枯草杆菌中 约20%的基 因具有 riboswitch 调控机制. Genome Research, 6:315, 2005 mRNA的定位机制 1) mRNA的局限合成 2) mRNA的局限保护性降解 3) mRNA的扩散: 随细胞骨架的组装极性 分布 4) 区域锚定: 主动运输, 依赖顺式元件和反式因子转移到工作场所.如神经细胞轴突生长与花粉管的伸长. 老鼠神经成纤维细胞β-actin mRNA的定位过程 ZBP1(Zip-code binding protein 1)蛋白控制β-actin mRNA转运及其翻译 的工作模型. ZBP1在细胞核中与β-actin mRNA结合, 输出细胞核后 立既与40S核糖体亚基结合, 并通过MP蛋白装载到细胞骨架运输线上. 在到达指定位置(突出生长边缘), 然后在Src激酶作用下ZBP1与 mRNA脱离, 释放的mRNA和40S 亚基再与60S亚基结合起始翻译. 见: Nature 438:512-515, 2005 mRNA的降解 1) mRNA的降解是基因表达调控的重要内容之一, mRNA的降解涉及正常mRNA和异常mRNA。 2) 真核细胞中有一定比例的异常mRNA,它们 具
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