蛋白质序列特征分析~生物信息学.ppt

4、信号肽—SIGNAL PEPTIDE 信号肽是指新合成多肽链中用于指导蛋白质跨膜转移的末端(通常为N末端)的氨基酸序列。信号肽中至少含有一个带正电荷的氨基酸,中部有一个高度疏水区以通过细胞膜。信号肽假说认为,编码分泌蛋白的mRNA在翻译时首先合成的是N末端带有疏水氨基酸残基的信号肽,它被内质网膜上的受体识别并与之相结合。信号肽经由膜中蛋白质形成的孔道到达内质网内腔,随机被位于腔表面的信号肽酶水解,由于它的引导,新生的多肽就能够通过内质网膜进入腔内,最终被分泌到胞外。 蛋白质的前导肽—LEADER PEPTIDE 前导肽是信号肽的一种。在线粒体蛋白质的跨膜转运过程中,通过线粒体膜的蛋白质在转运之前大多数以前体形式存在,它由成熟蛋白质和N端延伸出的一段前导肽共同组成。迄今已有40多种线粒体蛋白质前导肽的一级结构被阐明,它们约含20~80个氨基酸残基,当前体蛋白跨模时,前导肽被一种或两种多肽酶所水解转变成为成熟蛋白质,同时失去继续跨膜的能力。 前导肽一般具有以下特性:(1)带正电荷的碱性氨基酸(特别是精氨酸)含量较为丰富,它们分散于不带电荷的氨基酸序列之间;(2)缺失带负电荷的酸性氨基酸;(3)羟基氨基酸(特别是丝氨酸)含量较高;(4)有形成两亲(既有亲水又有疏水部分)α-螺旋结构的能力。 利用SIGNALP分析蛋白质的前导肽 Si

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