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- 2017-01-01 发布于湖北
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第三章核酸数据库的应用讲述
序列对比报告 对比资源 类似性图谱 对比图谱报告 数据库标识符 基因定义 类似性积分 E值为匹配期望值。说明可以找到与搜索序列相匹配的其它序列的几率。E值越接近零,越不可能找到其它的匹配序列,其背后的含义就是E值越少,匹配度越好 点击可得待检序列与库存序列对排 基因表达库链接 单基因库 基因信息库 人类染色体上的抗肿瘤基因序列对排表 相关文献链接 对排序列 不一致处 序列对排报告 第四节 新序列的提交 提交信息到NCBI、EBI和DDBJ的过程非常简单。介绍三种方式: 一、Internet的方式,如BankIt,为在线序列数据提交工具,基于互联网直接将数据库提交给GenBank的序列提交工具,提交的序列必须是提交者测定的DNA/RNA序列。输入的格式是FASTA;由E-mail给予回复;有基本的GenBank文本格式文件、GenBank存取号和完整的GenBank文本格式。 BankIt是一系列表单,包括联络信息、发布要求、引用参考信息、序列来源信息以及序列本身的信息等。用户提交序列后,会从电子邮件收到自动生成的数据条目。GenBank的新序列号及完成注释后的完整记录。用户还可在BankIt页面下修改已经发布序列的信息。 BankIt适于独立测序工作者提交少量序列,不适于提交很长的序列,EST序列和GSS序列也不用BankIt提交。 二、通过Seq
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