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典型相关分析典型相关分析
相关分析的类型
典型相关分析:用于探究一组解释变量与一组反应变量时间的关系。
典型相关分析函数:cancor(x,y,xcenter=T,ycenter=T)
x为第一组变量数据矩阵
y为第二组变量数据矩阵
xcenter表示第一组变量是否中心化
ycenter表示第二组变量是否中心化
自编典型相关函数:cancor.test(x,y,plot=T)
x为第一组变量数据矩阵
y为第二组变量数据矩阵
plot为是否绘制典型相关图
例1:d11.1 生理指标与训练指标之间的典型相关性。
生理指标:体重(x1)、腰围(x2)、脉搏(x3);
训练指标:引体向上次数(y1)、起坐次数(y2)、跳跃次数(y3)。
X-read.table(clipboard,header=T)
R-cor(X)
R
x1 x2 x3 y1 y2 y3
x1 1.0000 0.8702 -0.36576 -0.3897 -0.4931 -0.22630
x2 0.8702 1.0000 -0.35289 -0.5522 -0.6456 -0.19150
x3 -0.3658 -0.3529 1.00000 0.1506 0.2250 0.03493
y1 -0.3897 -0.5522 0.15065 1.0000 0.6957 0.49576
y2 -0.4931 -0.6456 0.22504 0.6957 1.0000 0.66921
y3 -0.2263 -0.1915 0.03493 0.4958 0.6692 1.00000
R11-R[1:3,1:3];R12-R[1:3,4:6];R21-R[4:6,1:3];R22-R[4:6,4:6]
A-solve(R11)%*%R12%*%solve(R22)%*%R21 #A=(R11)-1 R12 (R22)-1 R21
ev-eigen(A)$values #特征值
sqrt(ev) #典型相关系数
[1] 0.79561 0.20056 0.07257
以上过程是一步一步计算的,接下来我们使用R自带的典型相关函数:
xy-scale(X) #数据标准化
ca-cancor(xy[,1:3],xy[,4:6]) #典型相关分析
ca$cor #典型相关系数
[1] 0.79561 0.20056 0.07257
ca$xcoef #x的典则载荷
[,1] [,2] [,3]
x1 -0.17789 -0.43230 0.04381
x2 0.36233 0.27086 -0.11609
x3 -0.01356 -0.05302 -0.24107
ca$ycoef #y的典则载荷
[,1] [,2] [,3]
y1 -0.08018 -0.08616 0.29746
y2 -0.24181 0.02833 -0.28374
y3 0.16436 0.24368 0.09608
典型变量的系数载荷并不唯一,只要是它的任意倍数即可,所以每个软件得出的结果并不一样,而是相差一个倍数。
R自带的典型分析函数cancor()并不包括对典则相关系数的假设检验,为了方便,使用自编典型相关检验函数cancor.test()。
cancor.test(xy[,1:3],xy[,4:6],plot=T)
$cor
[1] 0.79561 0.20056 0.07257
$xcoef
[,1] [,2] [,3]
x1 -0.17789 -0.43230 0.04381
x2 0.36233 0.27086 -0.11609
x3 -0.01356 -0.05302 -0.24107
$ycoef
[,1] [,2] [,3]
y1 -0.08018 -0.08616 0.29746
y2 -0.24181 0.02833 -0.28374
y3 0.16436 0.24368 0.09608
$xcenter
x1 x2 x3
-5.551e-18 -1.943e-17 1.821e-17
$ycenter
y1 y2 y3
-2.776e-17 3.331e-17 3.365e-17
cancor test:
r Q
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