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蛋白免疫印迹杂交(Western Blot, WB)
WB是将蛋白样本通过聚丙烯酰胺电泳按分子量大小分离,再转移到杂交膜上,然后通过一抗/二抗复合物对靶蛋白进行特异性检测的方法。WB 是进行微量蛋白质分析比较成熟的技术之一。以下是总结Western Blot 操作方法及常见问题分析,有助于成功完成WB。
A第一部分:蛋白样本提取制备
蛋白样品制备是Western Blotting的第一步,更是决定WB成败的关键步骤,总体原则和注意事项:
尽可能提取完全或降低样本复杂度只集中于提取目的蛋白(通过采用不同提取方法或选择不同的试剂盒产品);
保持蛋白处于溶解状态(通过裂解液的pH 、盐浓度、表面活性剂、还原剂等的选择);
提取过程防止蛋白降解、聚集、沉淀、修饰等,(低温操作,加入合适的蛋白酶和磷酸酶抑制剂);
尽量去除核酸,多糖,脂类等干扰分子(通过加入核酸酶或采取不同提取策略);
样品分装,长期于-80℃中保存,避免反复冻融。
方法的选择
自行配制抽提试剂,根据文献方法或经验提取 ;
购买商品化试剂盒,按其说明书的方法提取 。
Example 1:
实验中提取肾脏总蛋白,具体实验过程如下:
提前一天4℃解冻RIPA,一定要完全融化;配PBS(用于细胞试验则需高压);
配制裂解液:PMSF:RIPA=1:99,PMSF终浓度为100mM(根据样本数配制所需的量,临用临配);
裂解组织:每个样品称取100mg,加1ml裂解液,匀浆后4℃静置2h使其充分裂解,14000g,4℃离心10min,取上清。
蛋白定量:取少量上清稀释30倍蛋白定量,然后计算出各样本原液蛋白浓度。注意由于裂解液里含有较高浓度的洗涤剂,蛋白定量不能选用Bradford法,可以选用改良的Lowry’s法或者BCA法。
样品蛋白浓度均一化:根据蛋白定量计算的结果将各样品蛋白浓度调整一致。具体方法为加入PBS稀释至样品浓度一致,本次蛋白浓度为3mg/ml。
分装并存于-80℃,避免反复冻融。
B 第二部分:
相关试剂的配制:
10%的SDS(戴口罩称取):
称取SDS10g,先加双蒸水80ml,再用磁力加热搅拌助溶,然后定容至100ml。室温保存,如在长期保存中出现沉淀,可在50℃水浴溶化后,仍可使用。
1.5M Tris/HCL(pH8.8)
Trisbase 18.17g,溶解于80ml双蒸水,用浓盐酸调pH至8.8,最后定容至100ml,室温下保存。
0.5M Tris/HCL(pH6.8)
Trisbase 6.06g,溶解于80ml双蒸水,用浓盐酸调pH至6.8,最后定容至100ml,室温下保存。
30%丙烯酰胺/0.8%N,N’-亚甲丙烯酰胺
甲叉双丙烯酰胺 2g 加双蒸水150ml,37℃加热溶解后,定容至250ml,查证该溶液pH应不大于7.0丙烯酰胺具有很强的神经毒性并可通过皮肤吸收,其作用具有累积性。称量丙烯酰胺和N,N’-亚甲丙烯酰胺时应戴手套和。可认为聚丙烯酰胺无毒,但也应谨慎操作,因为它还可能含有少量未聚合材料。
0.5mM Trisbase(pH6.8) 2.5ml 甘油 2.0ml 10%SDS 4.0ml 0.4%溴酚蓝(mw669.97) 1ml 二巯基乙醇(mw78.14) 0.5ml 注:配好后分装-20℃保存。
电泳缓冲液
10倍储存液 1倍应用液 Trisbase 30g 3g 甘氨酸 144g 14.4g SDS 10g 1g 加水至1000ml,PH值用HCl调8.3。已经配制了1000ml的储存液。电泳缓冲液用应老师的电泳槽应用液300ml。用10倍的储存液30ml加入水270ml。
转移缓冲液(临用临配,铁盒子里搅拌混匀并4℃预冷):
Tris base 甘氨酸 H2O(ml) 甲醇(ml) 终体积(ml) 0.606g 2.88g 160 40 200 2.424g 11.52g 640 160 800 2板胶转移缓冲液的用量约为200ml。
洗涤缓冲液(TBS)
10倍储存液 1倍应用液 Tris base 24.2g 2.42g
NaCl 80g 8g
加水800ml,用HCL调整PH为7.6,再加水至1000ml,已经配制了1000ml的TBS液,临用时再加0.1%的Tween-20。一般做两板胶要用洗涤缓冲液500ml;用储存液50ml加入450ml水,后加0.5ml Tween-20。
封闭缓冲液(5%脱脂奶粉)—10ml/膜
脱脂奶粉 2g 洗涤缓冲液 40ml 两板胶4张膜要用封闭缓冲液40ml。
具体实验步骤:
准备:
准备器材:10%过硫酸铵;冰盒;预热恒温加热器;拿出试剂(双丙和TEMED提前从冰箱拿出平衡,否则凝胶
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