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- 2017-01-12 发布于重庆
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“酶”处理染色质免疫沉淀(琼脂糖微球式).
“酶”处理染色质免疫沉淀(琼脂糖微球式)操作方法
试剂:
甘氨酸溶液(10X)
(4X)
(4X)
ChIP(10X)
ChIP(2X)
5 M NaCl
0.5 M EDTA
1M DTT
DNA漂洗(缓冲)液
DNA洗脱(缓冲)液
DNA纯化柱
蛋白酶混合抑制剂(200X)
(10 mg/ml)
微球菌核酸酶(2000 gel units/μl)NEB #M0247S
蛋白酶K(20 mg/ml)NEB #P8102S
人对照基因RPL30外显子3引物
小鼠对照基因RPL30内含子2引物
组蛋白H3(D2B12)XP?(ChIP) #4620
#2729
ChIP级蛋白G琼脂糖微球 #9007
不包含的试剂:
PMSF (0.1 M)
乙醇(96-100%)
1X PBS
无核酸酶的水
Taq DNA聚合酶
dNTP(三磷酸脱氧核苷酸)混合液
体内交联,细胞核制备并用核酸酶S7消化染色质
开始之前:
每次实验需要刺激或处理大约4X 107个细胞。这些细胞中提取的染色质可以用于多达10次单独的免疫沉淀实验。
以Hela细胞为例,这相当于5个15 cm培养皿中细胞密度达到90%时的总细胞数(一般每个盘中的培养基为20 ml)。
另外准备一盘细胞用于血球计数板法测定细胞数。
取出并需预热的试剂:
200X蛋白酶混合抑制剂
1 M的二硫苏糖醇
0.1
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