基于EMCCD叶绿素荧光信号的检测与处理报告.docVIP

目录 第一章 前 言 1 1.1 研究背景 1 1.2 叶绿素荧光原理 2 1.3 叶绿素荧光的吸收光谱和发射光谱 3 1.4 研究方法 5 第二章 图像采集系统的搭建 7 2.1采集系统的构建 7 2.2硬件的选择 8 2.2.1光源 8 2.2.2 滤光片 8 2.2.3 图像采集 9 2.3图像采集软件 9 第三章 图像处理 10 3.1 MATLAB简介 10 3.2图像预处理 10 3.2.1去背景 11 3.2.2伪彩色 11 3.2.3统计分析 13 第四章 实验 14 4.1研究对象简介 14 4.2实验设计 15 4.2.1快速性水分胁迫实验 15 4.2.2 慢速水分胁迫实验 15 4.3实验数据分析 15 4.4实验结果 18 第五章 结论 19 5.1全文总结 19 致 谢 20 参考文献 21 附 录 22 附录A：英文原文 22 附录B：中文译文 28 附录C：Matlab程序代码 32  第一章 前 言 1.1 研究背景 随着我国人口数量的极具增长，粮食问题也日益被人们所重视，因此农业的发展也显得十分重要，利用科学技术来促进农业的发展势在必行。而在农业生产中，环境中有许多污染、病虫害对农作物的生长构成威胁，所以需要实时对农作物的生长状态进行监控，以便极早预防病、虫害来提高农作物的产量。近年来，对农作物生长状态的监控方式有很多，但传统的监控方式大多采用现场取样，实验室分析，这样的监控方式容易破坏实验样本，同时对研究设备要求极高，观察周期长，需要投入大量的人力、物力和财力。因此，探索一种便携、高效、经济和实时的监控方式是特别重要的。 近年来，生物科学技术的飞速发展为对作物的研究提供了技术保障。农作物的生长状况与环境息息相关，不同环境胁迫对植物的伤害会直接反应在植物的花、茎、叶等器官上，因而对农作物的生长状态进行观察和研究对预防灾害有着重要的意义。而叶绿素又是植物生命活动的重要参与者，能快速、全面、准确地反应植物自身生长情况 图1-2 叶绿素吸收光谱 由图可知，叶绿素a和叶绿素b对红光和蓝紫光有很强的吸收作用，而对绿光的吸收量极少，几乎全部以反射形式辐射出去，这也是大部分植物的叶片呈现绿色的原因。叶绿素a和叶绿素b的吸收光谱虽然相似，但也有细微的不同。如图1-1所示，白色曲线是叶绿素a的吸收光谱，蓝色曲线是叶绿素b的吸收光谱，可以看出，叶绿素a在蓝紫光区域的吸收峰值为430nm，红光区域的吸收峰值为660nm，而叶绿素b在蓝紫光区域的吸收峰值为435nm，红光区域的吸收峰值为643nm，两种叶绿素的吸收谱线有微小平移[2]。 2）叶绿素发射光谱 图1-3 叶绿素发射光谱 叶绿素的发射光谱如图1-3所示，叶绿素荧光发射光谱由 400nm~650nm短波长成分(BGF)和650nm 以上的长波长成分(RF和FRF)构成。其中，短波长成分的强度峰值在450nm~480nm波段附近，而长波长成分强度峰值在680nm~685nm和730nm~740nm波段附近。短波长处的叶绿素荧光主要来源是叶绿素分子中的共价结合与细胞壁上的苯乙烯酸，主要是阿魏酸，长波长680nm~685nm处的叶绿素荧光则主要来自于和光合作用第二阶段有关的叶绿素，长波长 730nm~740nm 处的叶绿素荧光主要来自于光合作用第一和第二阶段中的天线色素。 综上所述，叶绿素荧光采集系统的光源应该分布在叶绿素对光的最强吸收处，如此才能激发叶绿素荧光 ；而荧光采集器应该覆盖叶绿素的发射光谱，这样才能获取有效信息。 1.4 研究方法 目前国际上对叶绿素的研究方法主要有荧光诱导动力学、荧光光谱和荧光图像三个方面。 1) 叶绿素荧光诱导动力学 叶绿素经光诱导后会产生荧光，荧光强度也会随时间而发生变化，先由一定强度水平迅速增长到最高值，称为快速荧光，再经过一段时间衰减直至稳定强度水平，称为慢速荧光。整个过程被称之为荧光诱导动力学，叶绿素荧光强度随时间变化的曲线被称为叶绿素荧光诱导动力学曲线。曲线的快相阶段与植物光合作用的光反应过程关系密切，而慢相阶段和植物光合作用的暗反应过程关系密切，可准确获得光合作用中电子传递和二氧化碳固定的情况，同时可间接反映出植物体内营养元素的变化和植物受逆境胁迫的情况[3]。 2) 叶绿素荧光光谱分析 叶绿素荧光光谱在波长分布和强度分布上均具有其独特的性质，随着光电探测和光谱分析等先进技术的飞速发展，人们对叶绿素荧光光谱的研究也有了更深层次的了解。在叶绿素荧光光谱分析领域，主要采用的方法是主动诱导法，而且当前叶绿素荧光光谱的分析技术还处在科研阶段，主要应用在海洋环境监测领域和森林环境探测领域，在硬件系统的建立和算法的改进上仍有很大发展空间。 3) 叶绿素荧光图像分析