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《第二章蛋白质的结构与功能

第二章 蛋白质的结构与功能 蛋白质(protein)是生命的物质基础。种类繁多,人体含蛋白质种类在10万种以上。是生物体含量最丰富的生物大分子,约占人体固体成分的45%,细胞干重的70%。几乎所有的器官都含有蛋白质,并各自具有其特殊的结构,因而决定了蛋白质功能的多样性。 第一节 蛋白质的分子组成 (protein composition and construction ) 一、蛋白质的元素组成 蛋白质的元素主要有碳(50%~55%)、氢(6%~7%)、氧(19%~24%)、氮(13%~19%)。大部分蛋白质还含有硫,有的还含有少量的磷或铁、锰、锌、铜、钴、钼,个别还含有碘。蛋白质元素组成特点:含氮量很接近,平均为16%。1g氮相当于6.25g蛋白质。 测定出生物样品的含氮量可按下式计算出其蛋白质大致含量: 100g样品中蛋白质含量(g%)=每克样品中含氮克数×6.25×100 二、蛋白质的基本组成单位——氨基酸 (the basic unit of protein composition——amino acid) 氨基酸(amino acid)是组成蛋白质的基本单位。 (一)氨基酸的命名(略) (二)氨基酸的结构特点 自然界中的氨基酸有300余种,组成人体蛋白质的氨基酸仅有20种。都有相应的遗传密码,故又称为编码氨基酸。氨基酸的结构通式可用下式表示(R为氨基酸侧链): 虽然各种氨基酸结构各不相同,但都具有如下特点: 1.组成蛋白质的氨基酸都是α-氨基酸。即氨基均连在α-碳原子上。脯氨酸为α-亚氨基酸。 2.除甘氨酸外,其余氨基酸的α-碳原子是不对称碳原子,有两种不同的构型,即L型和D型。组成人体蛋白质的氨基酸都是L型,即L-α-氨基酸。 (三)氨基酸的分类 氨基酸的按侧链的结构和理化性质可分为4类: 非极性侧链氨基酸:甘氨酸(Gly),丙氨酸(Ala),缬氨酸,亮氨酸,异亮氨酸,丙氨酸,脯氨酸(Pro);侧链为烃基、吲哚环或甲硫基等非极性疏水集团。 非电离极性侧链氨基酸:色氨酸,丝氨酸,酪氨酸,半胱氨酸(Cys),蛋氨酸(Met),天冬酰胺,谷氨酰胺,苏氨酸;侧链上带有羟基、巯基或酰氨基等极性基团,具有亲水性,中性水溶液中不电离,但羟基和巯基在碱性溶液中可电离出H+而带负电荷。 酸性氨基酸:天冬氨酸,谷氨酸(Glu); 碱性氨基酸:赖氨酸,精氨酸,组氨酸。 20种氨基酸中,甘氨酸分子量最小,脯氨酸属亚氨基酸,但其亚氨基仍能与另一羧基形成肽链,它形成的肽键N原子上没有H,所以不可能形成氢键,结果凡是出现脯氨酸的部位,肽键走向转折,不能形成α螺旋。胱氨酸是由两个半胱氨酸脱氢后以二硫键结合而成,蛋白质中的半胱氨酸多数是以胱氨酸形式存在。 (四)氨基酸的理化性质: 1.具有两性解离的特性,在晶体状态下几纯水溶液中主要以两性离子存在。熔点高,除甘氨酸、丙氨酸及亮氨酸外都不溶于无水乙醇,几乎全不溶于乙醚。 2.化学性质 (1)????????????? 两性游离与等电点:由于所有氨基酸都含有一个碱性的氨基和一个酸性的α羧基,因此氨基酸是两性电解质,在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性,此时溶液的pH称为该氨基酸的等电点(isoelectric point, pI)。 (2)?一个氨基酸分子的α-羧基与另一个氨基酸分子的α-氨基脱水缩合形成的酰胺键称为肽键(peptide bond),是多肽及蛋白质的主要化学键。 (3) 紫外吸收性质:色氨酸,酪氨酸及苯丙氨酸的最大吸收峰在280nm波长附近,所以测定280nm的光吸收值是蛋白含量的快速测定方法。 (4)茚三酮反应(Ninbydrin reaction),氨基酸与茚三酮的水合物共热可缩合成蓝紫色的化合物,后者的最大吸收峰在570nm左右。脯氨酸、羟脯氨酸与茚三酮反应生成黄色化合物,同时释放CO2。 (五)氨基酸的连接方式 (the conjunction method of Amino acids in protein) 1.肽键与肽 在蛋白质分子中,氨基酸通过肽键相互连接。肽键是由一个氨基酸的α-羧基与另一个氨基酸的α-氨基脱水缩合形成的酰胺键(-CO-NH-)。 氨基酸通过肽键连接而成的化合物称为肽。由两个氨基酸形成的肽称为二肽,由三个氨基酸形成的肽称三肽。通常将10个以内的氨基酸形成的肽称为寡肽(oligopeptide),十肽以上者称为多肽(polypeptide)。多肽成链状,称为多肽链。肽链中的氨基酸因脱水缩合已不是完整的氨基酸,故称为氨基酸残基(residue)。蛋白质就是由许多氨基酸残基借肽键相互连接形成的多肽链。 多肽链有两端,有自由氨基的一端称氨基末端(amino terminal)或N端

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