基因与基因工组的结构与功能.ppt

顺反子 一个基因一条多肽链 4.2 基因的命名 基因的命名：基因名称Leu,－Z（基因座） 质粒 重组质粒前面要加P,等等P76 C值：真核生物单倍体基因组所包含的全部DNA总量称为该物种的C值。 C值愈大愈高等？关系密切的生物C值差异巨大？大量的DNA为非编码序列。 4.4病毒及其基因组 4.4.1 病毒基因组特点 简单，信息总量少，只含一种核酸，有基因重叠，间隔序列很短，功能相关基因成簇，为一个转录单元；噬菌体基因是连续的，但也有许多病毒基因是不连续的。 4.4.2 病毒的核酸 正链（直接作为mRNA 模板，反之为负链。 4.4.3 典型病毒基因组 4.4.3 噬菌体基因组 ΦΧ174噬菌体基因组 单链环状，5386个核苷酸对，11个基因，3个转录单元， 有重叠基因，基因间间隔区很小 SV40病毒基因组 SV40（simian sarcom avirus40 猴肉瘤病毒)属乳多空病毒类，是最小的DNA病毒之一。它可长期潜伏于猴肾细胞，对新生仓鼠有致癌性，体外试验还可使多种属细胞恶性转化。 腺病毒 腺病毒是一种无外壳的双链DNA病毒，基因组长约36kb，衣壳（capsid）呈规则的20面体结构，直径约80-110nm。 以病毒DNA开始复制为分界线，按转录时间的先后，将腺病毒基因大致区分为早期（E1~4）和晚期转录单位（L1~5）。各种腺病毒基因又可以进一步地分为更小的转录单位，如E1区可以进一步分为E1A和E1B，每个转录单位都至少有一个独特的启动子。病毒的两条链均有编码功能。 腺病毒基因组的两端各有一段100bp的反向末端重复序列（ITR），是复制的起始位点。在左端ITR的3′侧有一段长约300bp的包装信号（ψ）介导腺病毒基因组包装入病毒衣壳。对腺病毒而言，只有包括两端的ITR和包装信号（ψ）的约0.5kb的序列是顺式作用元件，也就是说必须由腺病毒载体自身携带，而其他的30余种蛋白都可以通过辅助病毒（或细胞）反式补足。 病毒基因组进入细胞核，就将进行一系列的复杂而有序的逐级放大的剪切和转录过程。腺病毒基因组进入细胞核后，细胞转录因子首先与E1A区上游的增强子结合，表达E1A蛋白，该蛋白的作用是调节细胞代谢，使病毒DNA更易于在细胞中复制。E1A蛋白还可以激活其他早期基因（E1B、E2A、E2B、E3和E4）的启动子，其中E2B驱动另外三个与病毒复制有关的早期基因转录单位末端蛋白前体（pTP, precursor terminal protein）、单链DNA结合蛋白（ssDBP, single-stranded DNA binding proteins）以及DNA聚合酶（DNA pol, DNA polymerase）的表达，这三个基因的表达产物紧密地结合成一个复合物，与至少三种细胞蛋白相互作用，启动病毒基因组的复制。 3 逆转录病毒 1.逆转录病毒一般分类 逆转录病毒可以说就是RNA肿瘤病毒。 第一个被发现的RNA肿瘤病毒是劳氏肉瘤病毒（Rous Sarcoma vivus, RSV, 1911)。至今为止所发现的retro-v都能使动物致癌，如下。 （1）肉瘤病毒 （2）白血病病毒(leuremia virus) （3）乳腺瘤病毒(mammazy tumor virus)和淋巴瘤病毒，如鸟类髓细胞瘤病毒（avian myelocytoma, AMV) （4）人类嗜T细胞逆转录病毒（human T-lymphotropic retro-v, HTLV)HTLV-III现称人类免疫缺陷综合症病毒（human immunodeficiency virus, HIV)或AIDS病毒。 2.逆转录病毒基结构特征 (1)是RNA的复合体 ①2条(+)RNA单体正向平行,携带所有的遗传信息,而且完全相同,为什么要求2条相同正链,意义不太清楚(怕基因丢失或损伤?)。 ②2条tRNA较小，是宿主tRNA(RSV是tRNAtrp），+RNA对于复制位置是至关重要。 (2)5’端有m7Gppp帽,3’端有Poly（A）尾。 (3)编码区（反式功能区）从5’→3’ 非编码区（顺序功能区，调控区)5’，3’都有 ①gag(groupantigen)编码衣壳蛋 ①R区 逆转录合成cDNA必须区域 ②Pov(Polyrmerase) 逆转录酶 ②PB区 引物结合区 ③env(envelop) 包膜蛋白 ③U区 U3含启动子，U5与转录终止加尾有关 *④ONC(oncogene) 癌基因 ④ψ(包装信号),DLS(氢链结合位点) 如RSV是SRC