生物信息学教学纲.docVIP

红河学院《生物信息学》课程教学大纲 一、课程基本情况与说明 （一）课程代码： （二）课程英文名称：bioinformatics （三）课程中文名称：生物信息学 （四）授课对象：生物科学和生物技术专业本科生 （五）开课单位：生命科学与技术学院 （六）教材： 1、生物技术专业：《生物信息学应用技术》，王禄山、高培基编，化学工业出版社，2008年 2、生物科学专业：《生物信息学基础》，孙啸、陆祖宏、谢建明编，清华大学出版社，2005年 （七）参考书目 [1]《生物信息学》，DavidW.Mount著，钟扬等译，高等教育出版社，2003年 [2]《基因组数据分析手册》，胡松年、薛庆中编，浙江大学出版社，2003年 [3]《生物信息学中的计算机技术( HYPERLINK /exec/obidos/tg/detail/-/1565926641/qid=1031709248/sr=1-1/ref=sr_1_1/002-9712811-0030400?v=glances=books \t _blank Developing Bioinformatics Computer Skills)》，Cynthia Gibas,Per Jambeck著，孙超等译，中国电力出版社，2002年 [4]《生物信息学：基因和蛋白质分析的实用指南》，Andreas D. Baxevanis，Francis Ouellette B F著，李衍达、孙之荣等译，清华大学出版社，2000年 [5]《生物信息学算法导论（An Introduction to Bioinformatics Algorithms ）》， HYPERLINK /search.aspx?category=01key2=%u743C%u65AF \t _blank 琼斯， HYPERLINK /search.aspx?category=01key2=%u5E15%u592B%u7EB3 \t _blank 帕夫纳著， HYPERLINK /search.aspx?category=01key2=%u738B%u7FFC%u98DE \t _blank 王翼飞等译， HYPERLINK /search.aspx?category=01key3=%u5316%u5B66%u5DE5%u4E1A%u51FA%u7248%u793E \t _blank 化学工业出版社，2007年 （八）课程性质（五号宋体加粗） 生物信息学是生命科学领域一门新兴的边缘学科，综合了生物学、计算机学、信息学、统计学等方面的知识。该学科在学生掌握生物化学、遗传学、分子生物学以及计算机应用、高等数学等相关知识的基础上开设，属于生物类专业的专业课程（必修或选修）。通过学习，学生能够加深对分子生物学和基因工程等课程的理解，并为进一步学习基因组学(genomics)和蛋白质组学(protemics) 奠定基础。 （九）教学目的 1、给学生介绍生物信息学的主要内容以及未来可能的发展方向，为学生构建相关知识体系，开阔学生的视野，为将来进一步学习、科研打下基础。 2、让学生了解生物信息学的基本研究方法，并能掌握应用其中的一些常用方法，以提高学生的科研能力，领会采用信息学技术去分析和探索大量核酸和蛋白质序列所蕴藏的生命意义的基本思路。 3、学习运用计算机软件来分析生物学问题，提高用理论来辅助、提高实验的设计和数据分析水平，加强对分子生物学实验结果的预测与分析等等的能力。 （十）教学基本要求 本课程应用性、实践性和操作性很强、对计算机水平要求较高。生物信息学的发源和领先地区又多在国外，大量的生物信息学数据库已经网络化，主要软件都由国外开发，因此对英语水平也有一定要求。考虑到这些特点，为实现本大纲的要求，应积极采用新教材、多媒体及计算机辅助教学等先进教学手段，同时注意提醒、强化学生的计算机和英语应用水平，提高教学效果。在教学过程中，要注意前修课程和后续课程的联系（包括生物专业英语）。 ①本课程是生物类专业高年级的课程，学生在生物领域已经有了相当基础知识，因此教学重点应放在几大学科（生物学、计算机学、信息学、统计学等）知识的综合上，着重讨论学科的交叉运用，注意对分子生物学知识的回顾、联系和应用。 ②对于生物信息学中的基本研究方法的学习，应是教师介绍、课堂讨论、课后作业相结合，通过学生的实践，深入掌握这些研究方法，能理解其算法，培养学生分析问题和解决问题的能力。重点、难点要突出。注意理论联系实际。 ③结合实际，介绍并提供当前热门的生物信息软件，并布置作业，让学生课下和课后实习。 ④对于作为必修课的专业，要在3个学分的课时中，进行不少于18个学时的上机和上网实验，对相应软件和数据库进行操作练习，并作为考核的重要内容。 （十一）学时数、学分数及学时数具体分配