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第13章 核酸的结构 核酸的组成 戊糖 核酸的分类就是根据所含戊糖种类不同而分为核糖核酸(RNA)和脱氧核糖核酸(DNA) 第一节 核苷酸 核苷酸的分类: (1)(核糖)核苷酸 (2)脱氧(核糖)核苷酸两类。 两者基本化学结构相同,只是所含戊糖不同。 一、碱基 (base) 碱基分两类:嘧啶碱和嘌呤碱。 1.嘧啶碱 嘧啶碱是母体化合物嘧啶的衍生物。 2. 嘌呤碱 3. 稀有碱基 除了5种基本的碱基外,核酸中还有一些含量甚少的碱基,称为稀有碱基。稀有碱基种类极多,大多数都是甲基化碱基。tRNA中含有较多的稀有碱基,可高达10%。 二、核苷 核苷是一种糖苷,由戊糖和碱基缩合而成。之间以糖苷键相连接。一般称之为N—糖苷键。核酸分子中的糖苷键均为β—糖苷键。 规律: (1)核苷中的戊糖为呋喃型的D-核糖或D-脱氧核糖,糖苷键均为β—糖苷键。 (2)对嘧啶核苷来说,糖的C1与嘧啶碱的N1相连;对嘌呤核苷来说,糖的C1与嘌呤碱的N9相连 (3)应用X射线衍射法已证明,核苷中的碱基与糖环平面互相垂直。 三、 核苷酸 核苷酸 八种核苷酸 M/单,D/二,T/三;P-磷酸(都表示5’磷酸) RNA的名称为单/二/三苷酸, DNA在单/二/三前加脱氧两字(d表示)。 如AMP称腺苷一磷酸(或腺苷酸) dAMP称为脱氧腺苷一磷酸(脱氧腺苷酸) 稀有核苷酸与上类似 (四)核苷酸的衍生物 生物体内分布最广和最重要的一种核苷酸衍生物。 ATP的性质 核酸合成的前体 是重要的能量转换中间体 ATP含两个高能磷酸键:水解时 可释放大量自由能,推动体内各种需能反应。 ATP也是磷酰化剂:磷酰化的底物具较高能量(活化分子),是许多生物化学反应的激活步骤。 (2)GTP (鸟嘌呤核糖核苷三磷酸) 生物体内游离存在,核酸合成的前体,也是一种高能化合物 具有类似ATP的结构 主要是作为蛋白质合成中磷酰基供体 在许多情况下, ATP 和 GTP 可以相互转换 (3)cAMP 和 cGMP cAMP 3’,5’环腺嘌呤核苷一磷酸 cGMP 3’,5’-环鸟嘌呤核苷一磷酸 ——细胞间信使 cAMP 和 cGMP 的环状磷酯键是一个高能键:pH 7.4时水解能约为43.9 kJ /mol,比 ATP 水解能高得多。 第二节 核酸的共价结构 一、核酸的共价结构也就是核酸的一级结构,通常是指核酸的核苷酸序列。 核酸一级结构的简写形式 二、DNA的一级结构 1.定义 一级结构指核酸的核苷酸排列序列。 2.特点: (1)碱基组成:A、T、C、G,戊糖为脱氧核糖。 (2)各核苷酸之间通过3’ 5’磷酸二酯键相连 (3)DNA无分支链,相对分子质量非常大 (4)各物种的DNA基因组结构特点不同 1. 细菌(原核生物)的基因组结构特点 连续、无内含子,功能相关的基因组成操纵子,有共同的调控序列,很少有重复序列。 内含子(intro):真核生物的基因通常是断裂基因,保留在成熟RNA中的序列称为外显子(exon),插入的非编码序列称为内含子。 操纵子:指原核生物基因表达的协调单位,包括在功能上彼此相关的基因及其调控部位,调控部位由启动子和操纵基因(阻遏蛋白结合区)所组成。 2. 真核生物的基因组特点 断裂、有内含子、功能相关基因不形成操纵子,调控序列所占比例大,有大量重复序列。例如:人的基因组大小为3.2X109 bp,但编码蛋白质的序列仅占基因组的1%-1.4% 3. 病毒基因组的特点 基因组较小,但十分紧凑,有的基因是重叠基因。 重叠基因:指调控具有独立性,但部分使用共同基因序列的基因。 三、RNA的一级结构 一级结构共同特点: (1)碱基由A、U、C和G组成,另外还有一些稀有碱基 (2)戊糖不是脱氧核糖,而是核糖 (3)组成RNA的核苷酸也是以3 ’ 5’—磷酸二酯键彼此连接起来的;所以也是无分支线型多聚核苷酸 (4)RNA种类多,结构差异大 主要种类为tRNA, rRNA, mRNA。 1. tRNA结构特点: tRNA通常由73至93个核苷酸组成,相对分子质量都在25 000左右,沉降常数为4S。含有较多稀有碱基,可达碱基总数的10%~15%。 沉降系数:指在单位离心力的作用下粒子的沉降速度,以svedberg表示,简写为S,单位为时间,1S = 1×10-13 s 2. rRNA结构特点: 细菌的rRNA有5S、16S和23S三种, 哺乳动物的rRNA有5S、5.8S、18S和28S四种, rRNA核苷酸数一般100多个bp ,少数有稀有碱基 原核生物以操纵子作为转录单位,产生多顺反子mRNA(一条mRNA链上有多个编码区),5’端和3’端各有一段非翻译区(untranslated
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