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历史与背景

2006-05-24 复旦大学图书馆文献检索教研室 网络医学文献数据库 PubMed PubMed ——NCBI网站简介 1988年,美国的参议员 Claude Pepper 发起, 1988年11月4日通过立法建立国立生物技术信息中心(NCBI) NCBI的任务: 建立基于计算机信息处理的分子生物学、生物化学、遗传学知识的自动存储和分析系统,并进行先进方法的研究。 促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用。 促进全世界范围内生物技术信息收集的合作 NCBI生物信息整合系统 All database 检索大分子生物学数据 获取GenBank, EMBL等数据库的核酸序列; 获取Swiss-port,PIR,PRF,PDB等蛋白质序列;从核酸序列翻译到蛋白质的序列; 获取基因和染色体图谱;蛋白质三维结构数据及大分子模式(MMDB)等其他生物信息数据库检索。 PubMed书目文献数据。 PubMed 数据类型:期刊论文、综述、以及与其他数据资源链接。 特点: 1.免费提供题录和文摘 2.提供与原文的网址链接(部分免费获取) 3.提供检索词自动转换匹配 4.操作简便、快捷 数据收录 MEDLINE 4800余种生物医学期刊,内容涉及医学、护理、牙科、兽医、健康保健系统、前临床医学等学科。这些期刊来源于美国和世界上70多个国家和地区。 文献量达1千2百多万条记录,并回溯到1966年。 记录中[indexed for MEDLINE]标记 [注] 截止2006年3月15日PubMed公布的数据 数据收录 In process citation 提供MEDLINE尚未经规范处理的数据。 获MeSH词后,再加入MEDLINE。 记录中[in process]标记。 数据收录 Publisher Supplied Citations 出版商直接向PubMed提供电子记录 包括MEDLINE未收录的部分记录 [PubMed-as supplied by publisher]标记 数据收录 OldMedline 1950-1965年间发表的200多万篇文献 没有MeSH字段和摘要 [PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966]标记 PubMed not Medline PubMed 收录Medline不收录的文献。 [PubMed]标记 PubMed 与MEDLINE的区别 收录范围广: MEDLINE收录的部分生命科学相关文章的非医学专业期刊(物理、天文、化学等) 收录记录新: 在MEDLINE数据标引前的最新题录 文献类型全: 提供电子原文链接(部分免费) 二.PubMed 基本检索规则 截词检索:treat* 强迫短语检索:“brca 1”(不再自动转换匹配和扩展检索) 二.PubMed 基本检索规则 自动转换检索词 (automatic term mapping) 自动对照规范词表,期刊名表,短语,著者名索引, 依次寻找转换 短语寻找转换 单词转换 单词在上述四个字段寻找转换 在所有字段中转换 如:输入stem[ti] AND neuroscience Details显示: stem[ti] AND ((neurosciences[TIAB] NOT Medline[SB]) OR neurosciences[MeSH Terms] OR neuroscience[Text Word]) 二.PubMed 基本检索规则 自动扩展检索 系统自动对主题词、副主题词进行扩展检索,如: 输入“hypertension therapy,系统自动将高血压的药物治疗、饮食疗法, 三.PubMed的辅助检索 Limits(检索限制选择) 字段限制:著者、刊名、篇名、滤过(filter原文收藏处)等 数据输入时间:默认检索可回溯到1950年,限制选择30天-10年 7种文献类型限制 7种语种限制 12种子文档:(01年新增2种Space Life Sciences and Bioethics ) PubMed记录字段说明 Previw/index(检索策略预览) 浏览检索式 改变检索式 (可用检索式编号#1 OR #2) 浏览索引(index) Index(索引字顺表) 选择限制字段 输入检索词(词根) 在字顺表中选择检索词 选用逻辑算符建立检索式 点击GO 检索式回顾 编辑检索式 如#3 AND child Details (匹配过程) 显示检索词转换匹配运算详细过程 用途:转换、确定规范词 如:liver cancer liver neoplasms 修改检索策略

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