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(生物制品相关概念

1.拷贝数拷贝数就是指某基因(可以是/view/20005.htm \t _blank质粒)在某一生物的基因组中的个数. 单拷贝就是该基因在该生物基因组中只有一个,多则指有多个。(一)在细菌细胞中,某种特定质粒的数目。根据复制特性,质粒分严紧型和松弛型两类,前者在细胞中只含1~2个,而后者含10~15个以上。恒定的/view/1321865.htm \t _blank拷贝数与质粒复制控制系统、/view/1495623.htm \t _blank宿主细胞/view/3873741.htm \t _blank遗传背景及生长条件有关。质粒复制/view/57978.htm \t _blank控制系统首先通过调节复制的起始点来控制拷贝数,调节因素包括/view/2407838.htm \t _blank阻遏蛋白、/view/299723.htm \t _blank反义RNA和某些顺向重复序列。有些质粒还有其他控制系统,如有分配功能的par系统和确保质粒稳定遗传的ccd系统。一旦质粒上与调控有关的基因或位点突变,可使拷贝数明显增加或减少。(二)在细菌细胞中,某种特定基因的数目。检测方法:1)Southern blot:Southern blot 是一种常用的 DNA 定量的分子生物学方法。其原理是将待测的 DNA 样品固定在固相载体(硝酸纤维膜或尼龙膜)上,与标记的核酸探针进行杂交,在与探针有同源序列的固相 DNA 的位置上显示出杂交信号,通过检测信号的有无、强弱可以对样品定性、定量,从而计算出转入的拷贝数。 Southern 法准确性高、特异性强,但存在费时费力的缺点。另外,由于 Southern 法检测不经过靶片段的扩增( PCR ),一般每个电泳通道需要 10-30 μ g 的 DNA ,在实际操作中就需要较大量的植物材料来提取 DNA ,而转基因植物的愈伤组织在无菌条件下经过筛选、重新分化后一般都比较细弱,不宜大量取样。如果外源基因在插入时发生基因重组,造成限制性酶切位点丢失, Southern 法也无法检测到。这些因素都制约了 Southern 法在 T 0 代转基因植物中检测外源基因拷贝数的应用。2)实时荧光定量PCR:其定量的基本原理是在 PCR 反应体系中加入非特异性的荧光染料(如: SYBR GREEN I )或特异性的荧光探针(如:Taqman 探针),实时检测荧光量的变化,获得不同样品达到一定的荧光信号(阈值)时所需的循环次数: CT 值(Cycle Threshold);通过将已知浓度标准品的 CT 值与其浓度的对数绘制标准曲线,就可以准确定量样品的浓度。荧光定量 PCR 技术具有简便、快捷的优点,能够有效扩增低拷贝的靶片段 DNA ,对每克样品中 20pg-10ng 的转基因成分进行有效检测。同时,与 Southern 法相比,荧光定量 PCR 技术可对 T-DNA 的不同序列进行扩增,因此能实现对转基因品系中的基因重组的检测(Giovanna 2002)。2.什么是总离子流色谱图 Q:液质联用的总离子流色谱图,横坐标出峰时间,纵坐标峰高,这个峰高到底是什么?通过液相分离到达质谱时间不一样,那是不是同一个时间到达检测器的离子可能是不同的质量,也就是它这个总粒子流色谱图某一时间对应的点不是单一的质量? A:严格来说应该叫总离子流图,已经不是色谱图了,纵坐标高还是代表物质总生的总离子信号,和色谱峰面积比例接近,当然也有时有离子流峰不一定有色谱峰,特殊情况也很多.一个总离子流图由好多峰组成,这些峰出峰先后是按色谱出峰先后顺序排列的.在同一峰,又由好多不同质荷比的碎片组成,在质谱中,同一个离子流峰中不同的质荷比的碎片也按小到大的顺序先后检测到,形成质谱图.离子流图的一点和质谱图的某一点都不一定是纯的,因为存在色谱分离度和质谱分辨率的问题.色谱柱效足够高,分析方法足够好,总离子流图一个点的物质就越来越单一,分辨率越高质谱图某一点的峰纯度也越高。3.翻译后修饰 翻译后修饰是指蛋白质在翻译后的化学修饰。对于大部份的蛋白质来说,这是蛋白质生物合成的较后步骤。 前体蛋白是没有活性的,常常要进行一个系列的翻译后加工,才能成为具有功能的成熟蛋白。加工的类型是多种多样的,一般分为以下几种:N-端fMet或Met的切除、二硫键的形成、化学修饰和剪切。当合成蛋白质时,20种不同的氨基酸会组合成为蛋白质。蛋白质的翻译后蛋白质其他的生物化学官能团(如醋酸盐、磷酸盐、不同的脂类及碳水化合物)会附在蛋白质上从而改变蛋白质的化学性质,或是造成结构的改变(如建立双硫键),来扩阔蛋白质的功能。 再者,酶可以从蛋白质的N末端移除氨基酸,或从中间将肽链剪开。举例来说,胰岛素是肽的激素,它会在建立双硫键后被剪开两次,并在链的中间移走多肽前体,而形成的蛋白

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