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生物化学难点参考[精选]
第一章 蛋白质结构与功能
蛋白质变性(protein denaturation):蛋白质在某些物理和化学因素作用下其特定的空间构象被破坏,从而导致其理化性质的改变和生物活性的丧失,这种现象称为蛋白质变性。
蛋白质的一级结构(primary structure): 蛋白质分子中,从N-端至C-端的氨基酸残基的排列顺序。
肽链(peptide chain):氨基酸通过羧基和氨基脱水后,缩合而成的呈现一维伸展形式的产物。
等电点(isoelectric point, pI):在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性。此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点。
模体(motif):一个蛋白质分子中几个具有二级结构的肽段,在空间位置上相互接近,形成特殊的空间构象,称为模体。
GSH 谷胱甘肽(glutathione)
血红蛋白与肌红蛋白的氧解离曲线有何不同?为什么?血红蛋白和肌红蛋白的氧饱和度曲线,也称氧结合或氧解离曲线。肌红蛋白的氧结合曲线呈双曲线,而血红蛋白呈S形曲线。这是因为每个肌红蛋白分子仅有一个O2的结合位置,因此每一肌红蛋白分子和O2的结合均是独立的,和其他肌红蛋白分子无关。而血红蛋白分子是由四个亚基所组成,每一亚基均有一个O2的结合位置,血红蛋白分子对O2的结合是四个亚基的协同作用的结果。这也反映了两种蛋白质的生理功能是不同的。肌红蛋白的功能是储备氧,只有当剧烈活动时血液输氧不足以补偿肌肉消耗而致局部氧分压很低的情况下,才放出氧来应急。而血红蛋白的功能是运输氧,所以它既能在肺筛泡的高氧分压条件下充分结合氧,又能在周围组织的低氧分压条件下将大部分氧释放出来。
何为蛋白质变性?变性的蛋白质理化性质有何改变,有何实际应用。
第二章 核酸结构与功能DNA的增色效应
Tm:融解温度(melting temperature, Tm) 变性是在一个相当窄的温度范围内完成,在这一范围内,紫外光吸收值达到最大值的50%时的温度。其大小与G+C含量成正比。
核酸分子杂交
dNTP:deoxy-ribonucleoside triphosphate(三磷酸脱氧核糖核苷)的缩写。是dATP, dGTP, dTTP, dCTP的统称,N代表变量指代A、T、G、C、U中的一种。在生物DNA、RNA合成中,以及各种PCR(RT-PCR、Real-time PCR)中起原料作用。
cAMP:“腺苷-3,5-环化一磷酸”的简称。亦称“环化腺核苷一磷酸”,“环腺一磷”。一种环状核苷酸,以微量存在于动植物细胞和微生物中。体内多种激素作用于细胞时,可促使细胞生成此物,转而调节细胞的生理活动与物质代谢。
tRNA的二级结构与功能的关系如何?3端含 CCA-OH 序列.因为该序列是单股突伸出来,并且氨基酸总是接在该序列腺苷酸残基(A)上,所以 CCA-OH 序列称为氨基酸接受臂。CCA 通常接在 3端第4个可变苷酸上.3端第5-11位核苷酸与5端第 1-7 位核苷酸形成螺旋区,称为氨基酸接受茎。
② TψC 环(TψCloop).TψC 环是第一个环,由7个不配对的硷基组成,几乎总是含 5GTψC3序列.该环涉及 tRNA 与核糖体表面的结合,有人认为 GTψC 序列可与 5SrRNA 的GAAC 序列反应.
③ 额外环或可变环。这个环的硷基种类和数量高度可变,在3-18 个不等,往往富有稀有硷基.
④ 反密码子环。由7个不配对的硷基组成,处于中间位的 3 个硷基为反密码子.反密码子可与 mRNA 中的密码子结合.毗邻反密码子的 3端硷基往往为烷化修饰嘌呤,其5端为 U,即:-U-反密码子-修饰的嘌呤.
⑤ 二氢尿嘧啶环由8-12 个不配对的硷基组成,主要特征是含有(2+1 或2-1)个修饰的硷基(D).
⑥ 上述的 TψC 环,反密码子环,和二氢尿嘧啶不分别连接在由 4 或5个硷基组成的螺旋区上,依次称为 TψC 茎,反密码子茎和二氢尿嘧啶茎.此外,前述的 15-16个固定硷基几乎全部位于这些环上.
DNA双螺旋结构的主要特点有哪些?
’→3’走向,另一股链是3’→5’走向。两股链之间在空间上形成一条大沟和一条小沟这是蛋白质识别DNA的碱基序列,与其发生相互作用的基础。
DNA双螺旋的稳定由互补碱基对之间的氢键和碱基对层间的堆积力维系。DNA双螺旋中两股链中碱基互补的特点,逻辑地预示了DNA复制过程是先将DNA分子中的两股链分离开,然后以每一股链为模板(亲本),通过碱基互补原则合成相应的互补链(复本),形成两个完全相同的DNA分子。因为复制得到的每对链中只有一条是亲链,即保留了一半亲链,将这种复制方式称为DNA的半保留复制。后来证明,半保留复制是生物体遗传信息传递的最基本方式。
第三章 酶L
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