02 多与蛋白质下.pptVIP

角蛋白keratin和胶原蛋白collagen NPY Why 鉴于细胞色素C分子在呼吸电子传递链中不可或缺的地位，其分子结构是相对保守的。但随着生物的进化，其分子组成结构也必将出现变异，只是相对于其他蛋白来说，细胞色素C分子的很多变异可能导致生物体的电子传递出现问题而导致死亡，因此，其分子进化要缓慢而保守 20-30%的蛋白质具有多态性 镰状红细胞性贫血 镰状细胞贫血是一种常染色体显性遗传血红蛋白(Hb)病。因β-肽链第6位氨基酸谷氨酸被缬氨酸所代替，构成镰状血红蛋白(HbS),取代了正常Hb(HbA)。患者是黑人或与黑人有血缘关系。 异常血红蛋白β链的第6位谷氨酸被缬氨酸所代替。这个疏水氨基酸正好适合另一血红蛋白分子β链EF角上的“口袋”，这使两条血红蛋白链互相“锁”在一起，最终与其他血红蛋白链共同形成一个不溶的长柱形螺旋纤维束，使红细胞扭旋成镰刀形。 反例 细胞色素(cytochrome C) 血红蛋白亚基与肌红蛋白结构类似 都含有血红素辅基 Aggregation of amyloid beta protein fragments 人类蛋白质组折叠计划/项目（The human Proteome Folding Project） Folding@home 人体体液pH7.4 蛋白质大多pI5.0, 大多解离为阴离子 碱性蛋白质：鱼精蛋白；组蛋白 酸性蛋白质：胃蛋白酶，丝蛋白 分子伴侣，热激蛋白。。。。 2-DGE双向凝胶电泳 气相色谱-质谱联用仪 吸附力 质谱分析是一种测量离子荷质比（电荷-质量比）的分析方法，其基本原理 是使试样中各组分在离子源中发生电离，生成不同荷质比的带正电荷的离子，经加速电场的作用，形成离子束，进入质量分析器，利用电场和磁场使发生相反的速度色散，将它们分别聚焦而得到质谱图，从而确定其质量。 五、利用蛋白质颗粒沉降行为不同可进行超速离心分离 超速离心法(ultracentrifugation)既可以用来分离纯化蛋白质也可以用作测定蛋白质的分子量。 蛋白质在离心场中的行为用沉降系数(sedimentation coefficient, S)表示,沉降系数与蛋白质的密度和形状相关 。 因为沉降系数S大体上和分子量成正比关系，故可应用超速离心法测定蛋白质分子量，但对分子形状的高度不对称的大多数纤维状蛋白质不适用。 s=v/ω2r。s是沉降系数，ω是离心转子的角速度（弧度/秒），r是到旋转中心的距离，v是沉降速度。 六、用化学或反向遗传学方法可分析或演绎多肽链的氨基酸序列 分析已纯化蛋白质的氨基酸残基组成（离子交换层析） 测定多肽链的氨基末端与羧基末端为何种氨基酸残基 把肽链水解成片段，分别进行分析 测定各肽段的氨基酸排列顺序，一般采用Edman降解法 一般需用数种水解法，并分析出各肽段中的氨基酸顺序，然后经过组合排列对比，最终得出完整肽链中氨基酸顺序的结果。 化学法 溶解法 二硝基氟苯法（DNP法） 肼解法 二甲基氨基萘磺酰氯法（Dansyl-氯法）还原成氨基醇法 亮氨酸氨肽酶法 细胞外氨肽酶法 羧肽酶A法 羧肽酶B法 羧肽酶C法 氨基酸和肽的末端测定法 通过核酸来推演蛋白质中的氨基酸序列： 按照三联密码的原则推演出氨基酸的序列 分离编码蛋白质的基因 测定DNA序列 排列出mRNA序列 七、应用物理学、生物信息学原理可进行蛋白质空间结构测定或预测 通常采用圆二色光谱(circular dichroism，CD)测定溶液状态下的蛋白质二级结构含量。 ?-螺旋的CD峰有222nm处的负峰、208nm处的负峰和198nm处的正峰3个成分；而?-折叠的CD谱不很固定。 （一）圆二色光谱可估算蛋白质二级结构比例 X射线衍射法(X-ray diffraction)和核磁共振技术(nuclear magnetic resonance, NMR)是研究蛋白质三维空间结构最准确的方法。 （二）X射线衍射法和核磁共振技术用于 三维空间结构分析 * 用分子力学、分子动力学的方法，根据物理化学的基本原理，从理论上计算蛋白质分子的空间结构。 （三）根据蛋白质的氨基酸序列预测三维空间 结构 * 通过对已知空间结构的蛋白质进行分析，找出一级结构与空间结构的关系，总结出规律，用于新的蛋白质空间结构的预测。 第六节 血浆蛋白质 Plasma Proteins 一、采用电泳法可将血浆蛋白质分成若干组分 电泳法是分离、分析血浆蛋白质的主要方法。采用醋酸纤维素膜电泳，可将血浆蛋白质分为5个组分。 按泳动快慢依次为：清蛋白、α1-、α2-、β-和γ-球蛋白（globulin）。而采用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PA