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第一篇 生物系统学概论 背景（Background） 生命的等级系统（hierachial systerm）,包括多个不同的组织的层次或水平：基因－细胞－组织－器官－物种－种群－群落－生态系统－景观－生物圈。 生物圈(biosphere)：为地球上全部的生命和一切适合于生物栖息的场所。它是地球上最大的、接近于自我维持的生态系统（self-sustaining ecosystem）. 生物圈的亚层次组织： 岩石圈（lithosphere）上层，栖息所有陆生生物。 水圈（hydrosphere），到处都有生命，主要集中在表层和底层。 大气圈（atmosphere）下层，生命主要集中于与岩石圈交界的最下层。 生物的分界（organismal kingdom）：地球上现生生物分为5界： 原核生物界（monera） 原生生物界（protista） 真菌界 （fungi） 植物界 （plantae） 动物界 （animalia） 第一章 生命的特征 1.1 生命系统的基本特征： 有机的生物界具有无限的多样性及连续性，其间又有不同层次的一致性或统一性。 生命的多样性（diversity）、连续性（extensibility）及一致性（consistence）是生命系统（life system）的重要特征。 1.2 多样性（diversity）或生物多样性（biodiversity） 定义： 生物与其环境形成的生态复合体（ecological integrate），以及与其相关的生态学过程（ecological process）的总和；它包括动物、植物、微生物及其基因，以及（它们）与其生物学环境形成的复杂的生态系统（ecosystem）。 主要生命层次的多样性 基因多样性（gene diversity）或遗传多样性（genetic diversity） 生物体内决定性状的遗传因子及其组合的多样性。它决定物种及生态系统两个层次的多样性。 物种多样性（species diversity）特定空间物种的丰富度（species richness）及其变化；它包括特定空间生物区系的现状（受威胁及特有性）、形成、演化、分布格局及其维持机制等。 同义语： 1. 生物多样性物种水平的多样性（diversity of species level in biodiversity）＝物种多样性 2. 物种水平的分类学多样性（taxonomic diversity of species level） 异义语： 群落及生态系统水平的生态学物种多样性（species diversity of ecology on community and ecosystem）; 特定生物群落或生态系统物种的丰富度及异质性（heterogeneity）(相对密度)或均匀性（equitability）的度量。 1.3 连续性（extensibility） 地球上各种生命有机体具有自我复制、繁衍和再生的能力。亦即生命的形式从低级到高级、从原始类型到复杂类型，都有繁衍、再生的本能。 1.4 一致性（consistency） 不同层次生命有机体，在结构和功能上，具有不同程度的共同特征。 1.5 多样性与一致性的关系 对物种的描述和清列，可构成生物学有关学科发展的基础。而生物种类的多样性，则是生命多样性的特定组分及概括，对生物学的深入发展具有最根本的意义。 第二章 系统论、生物系统学及分类学 2.1 系统论及系统学 系统论（systematic theory）认为：可以而且因该把研究的对象看作为系统来处理。 系统（system）是由作为整体组成的要素组成的。 系统论是一种科学的方法论，作为一门科学，它是科学的科学，是科学学。 系统学（systematics）：广义系统学是关于事物秩序（order）的研究，旨在将事物有序化（ordering）和合理化（rationality），即系统学是研究自然事物和自然过程之间关系的科学。 2.2 生物系统及生物系统学 生物系统（biological system）：生物有机体种类即其属性的多样性，以及生物体间的全部关系。 生物系统学（biosystematics）或系统生物学（systematic biology） 定义：生物系统学是系统地分析和综合研究生物及其生物层次系统，建立生物分类系统的系统科学。 目标及作用： 目标： 生物系统学的最终目的是识别并用语言及图解表达生命的次序，以及为生物学的其他研究提供总的参照系。 总参照系是表达事物和现象之间多种关系的系统；是以一种关系建立，又可解释其他关系的系统。以及总参照系比最初建立时有更广泛的应用性。 作用：通过