武汉大学分子模拟实验.docxVIP

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武汉大学分子模拟实验.docx

①甲基自由基能量得到构型后计算分子总能量------------ GAMESS Interface ------------GAMESS Job: Compute Properties B3LYP/6-31G(d)Total Energy = -24975.289 Kcal/Mol打开输出文件------------ GAMESS Interface ------------GAMESS Job: Run Frequency B3LYP/6-31G(d)Cp = 7.830 cal/(mol K)Cv= 7.830 cal/(mol K)Enthalpy = 22.353 Kcal/MolEntropy = 50.566 cal/(mol K)Frequencies = 0.7 14.65 17.54 328.15 636.09 700.68 748.25 1287.69 1430.78 3211.43 3686.58 3856.35 Gibbs Free Energy = 7.277 Kcal/MolHarmonic Zero Point Energy = 0 Kcal/MolInternal Energy = 21.761 Kcal/MolIR Spectrum Species:Transmittance (%) Wavenumbers----------------- ----------- 100.00 0.7000 100.00 14.6500 100.00 17.5400 0.00 328.1500 99.83 636.0900 52.81 700.6800 30.80 748.2500 91.80 1287.6900 89.51 1430.7800 86.05 3211.4300 94.28 3686.5800 95.41 3856.3500输出文件中可以看到甲基自由基仅有6个振转能级MODES 1 TO 6 ARE TAKEN AS ROTATIONS AND TRANSLATIONS. 1 2 3 4 5 FREQUENCY: 748.25 700.68 636.09 17.54 14.65 REDUCED MASS: 1.06500 1.04661 1.00821 3.69933 3.73266IR INTENSITY: 0.71118 0.48495 0.00178 0.00001 0.00000 6 0.703.741990.00001E(C)=-23735.4668kcal/molE(H)=-311.7854kcal/mol ------------------------------- THERMOCHEMISTRY AT T= 298.15 K ------------------------------- USING IDEAL GAS, RIGID ROTOR, HARMONIC NORMAL MODE APPROXIMATIONS. P= 1.01325E+05 PASCAL. ALL FREQUENCIES ARE SCALED BY 1.00000 THE MOMENTS OF INERTIA ARE (IN AMU*BOHR**2) 5.94468 5.95508 11.89852 THE ROTATIONAL SYMMETRY NUMBER IS 1.0 THE ROTATIONAL CONSTANTS ARE (IN GHZ) 303.31121 302.78162 151.53893 THE HARMONIC ZERO POINT ENERGY IS (SCALED BY 1.000) 0.031441 HARTREE/MOLECULE 6900.489329 CM**-1/MOLECULE 19.729509 KCAL/MOL 82.548265 KJ/MOLH298K-H0K=H298K-ZPE =22.353- 19.729509=2.623kcal/mol0K下生成焓ΔH=37.82kcal/mol298K ΔH =31.92kcal/mol298k ΔG=31.20kcal/mol②乙醇分子虚频与能垒高度分子拉扯后形状输出

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