组蛋白修饰选读.ppt

第 四 章 组 蛋 白 修 饰 DNA Packing 1. 如何将10,000公里长的蚕 丝(半径~10-5米)装入一个篮 球中。 2. 蚕丝的体积：3.14*10-3m3 3. 折叠、缠绕… DNA双螺旋片段 形成染色质的 “串珠球” 核小体形成的 30nm染色质纤 丝 扩展的染色体 片段 中期染色体的 浓缩片段 完整的中期染 色体 核小体 核小体 核小体的功能 除了在细胞核里面给DNA之间的紧密结合提供支架之外，核小体对于转录也有着很重要的调节作用，在转录启动的初期，核小体能阻止RNA聚合酶接近细胞不需要的成长区域。当细胞的需求发生改变的时候，染色质重组因子能改变核小体的部位以永续它们的接近。核小体同时还是染色质边界的标志，通过调节它们中心组蛋白的N-末端能够携带表型遗传信息。 核小体的组成 核小体是染色质（体）的基本结构单位，由DNA和组蛋白(histone）构成。由4种组蛋白H2A、H2B、H3和H4， 每一种组蛋白各二个分子，形成一个组蛋白八聚体，约200 bp的DNA分子盘绕在组蛋白八聚体构成的核心结构外面，形成了一个核小体。 组蛋白与核小体 组蛋白与核小体 组蛋白的性质和分类 组蛋白(histones)是真核生物体细胞染色质中的碱性蛋白质，富含精氨酸和赖氨酸等碱性氨基酸，精氨酸和赖氨酸加起来约为所有氨基酸残基的1/40。 组蛋白和非组蛋白 染色体中组蛋白以外的蛋白质成分称非组蛋白(nonhistone proteins)。绝大部分非组蛋白呈酸性，因此也称酸性蛋白质或剩余蛋白质。 非组蛋白是指细胞核中组蛋白以外的酸性蛋白质。非组蛋白不仅包括以DNA作为底物的酶，也包括作用于组蛋白的一些酶, 如组蛋白甲基化酶。此外还包括DNA结合蛋白、组蛋白结合蛋白和调节蛋白。由于非组蛋白常常与DNA或组蛋白结合, 所以在染色质或染色体中也有非组蛋白的存在, 如染色体骨架蛋白。 组蛋白的性质和分类 因为组蛋白富含带正电荷的碱性氨基酸，所以能够同DNA中带负电荷的磷酸基团相互作用，形成DNA组蛋白复合物。 组蛋白是一类小分子碱性蛋白质。 组蛋白的性质和分类 有五种类型：H1 、H2A 、H2B 、H3 、H4、 组蛋白的性质和分类 H1属于另一类组蛋白，它不参加核小体的组建，在构成核小体时起连接作用，并赋予染色质以极性。H1有一定的组织和种属特异性。H1的相对分子质量较大，在进化上也较不保守，由200多个氨基酸残基组成。不同生物的HI序列变化较大。在某些组织中，H1被特殊的组蛋白所取代。如成熟的鱼类和鸟类的红细胞中H1被H5所取代，精细胞中则由精蛋白代替。 组蛋白的性质和分类 组蛋白是已知蛋白质中最保守的 核心组蛋白高度保守的原因可能有两个:其一是核心组蛋白中绝大多数氨基酸都与DNA或其他组蛋白相互作用，可置换而不引起致命变异的氨基酸残基很少;其二是在所有的生物中与组蛋白相互作用的DNA磷酸二脂骨架都是一样的。 组蛋白 为了查找不同物种的组蛋白序列以及结构信息，可以访问组蛋白序列数据库(http://genome. nhgri. nih. gov/histones/) 染色质 染色质重塑 Euchromatin: 常染色质； Heterochromatin: 异染色质 E-H或H-E称为染色质重塑 (Chromatin Remodeling) 分子机理：DNA甲基化， 组蛋白修饰，依赖于ATP的染色质重塑复合物的协同作用。 组蛋白修饰 每个核心组蛋白都有两个结构域: 组蛋白的球形折叠区：与组蛋白间相互作用及缠绕DNA有关 氨基末端(N末端)结构域：位于核小体的球形核心结构以外(伸出核小体)，可同其他调节蛋白和DNA发生相互作用，并且可以发挥信号位点的作用，这些位点常被组蛋白乙酰转移酶、组蛋白甲基转移酶和组蛋白磷酸转移酶等作用，发生各种共价修饰。 组蛋白修饰 组蛋白修饰 组蛋白修饰 组蛋白修饰 组蛋白修饰种类 组蛋白的乙酰化 组蛋白的甲基化 组蛋白的磷酸化 组蛋白的泛素化 组蛋白的SUMO化 一、组蛋白的乙酰化 乙酰化修饰是通过组蛋白乙酰化酶的催化作用实现的。组蛋白乙酰化酶将乙酰CoA的乙酰基转移到组蛋白N末端尾区内赖氨酸侧链的?-氨基。 从组蛋白的球状域伸出的组蛋白N末端赖氨酸发生的乙酰化修饰可以通过电荷中和的方式削弱组蛋白-DNA或核小体核小体的相互作用，或引起构象的变化，破坏稳定的核小体结构。 乙酰化修饰后的组蛋白也可以募集其他相关因子(如转录复合物)进入到一个基因位点，从而影响转录。 组蛋白乙酰化位点 一、组蛋白的乙酰化 1. 通常发生在蛋白质的赖氨酸(K)上； 2. 可逆的生化反应： A. Histone acetyltransferase，HAT (30)