mpi实验虚拟机环境下两节点的MPI集群搭建-20140504-终稿.docVIP

信息学院 实验报告 学号： 姓名： 班级：网络工程 实验时间：2015年 5月26日 实验地点：睿智4栋303 开发环境：VMware-Ubunt14.04 课程名称：云计算 实验性质： 验证性实验 实验内容：虚拟机环境下MPI集群搭建 题目来源：教师布置 实验目的和任务 1. 了解建设高性能计算机集群系统的过程； 2. 熟悉利用MPICH搭建高性能计算机的方法； 3. 熟悉Ubuntu Linux操作系统配置与管理。 实验步骤 集群局域网网络环境搭建与配置。 Ubuntu 中root用户和user用户切换及密码设置（node1和node2）。 网络搭建和ip地址配置 node1 node2 测试网络的连通性node1 ping node2 2．修改计算机名/主机名、添加地址解析（两个节点node1和node2均需配置） （1）node1 （2）node2 修改完成，重启系统。 步骤二 创建SSH信任连接 安装SSH服务，在终端窗口输入如下命令 #sudo?apt-get?install?ssh? node1 node2 安装完毕重启 测试登录本机（需要密码） 测试从node1登录node2（互测：需要密码） Node2登录node1 6．计算节点之间的无密码访问（node1） 检查公私钥对文件： 将该密钥用作认证，进行访问授权。按如下命令在node1执行。（node1） 进入.ssh目录，生成authorized_keys文件 #cd .ssh abc@node1:~/.ssh# cp id_rsa.pub authorized_keys 7. 在node1安装/更新nfs服务器 1）#sudo apt-get install nfs-kernel-server nfs-common 2）创建共享文件夹 在node1（master或称server）的/home/abc目录下创建共享文件夹cluster，作为所有节点共享的目录（也可将MPICH2安装在该目录下，同时可以设置所有节点已启动便挂在该目录，便可只在主节点上安装一次MPICH即可。） 3）修改cluster目录所属的用户及组，使用ls?–al命令可以看到，??? 刚才创建的cluster目录属于root用户，需要将它的用户和组改为abc。 使用如下命令更改文件夹拥有者和群组： #sudo chown abc:abc /home/abc/cluster 编辑/etc/exports文件（共享文件夹访问权限设置）: #Sudo gedit /etc/exports 或 #sudo vi /etc/exports 3）重启服务 nfs是一个RPC程序，使用前，需要映射好端口。 重启portmap（新版本已替代为文件rpcbind） 重启nfs-kernel-server服务 root@node1: #sudo /etc/init.d/nfs-kernel-server restart 显示共享出的目录 4）安装完毕，挂载共享目录： 将node1共享目录/cluster挂载到各个节点的目录/cluster 在node2安装/更新nfs服务器 #sudo apt-get install nfs-kernel-server nfs-common 在node2上创建共享目录/home/abc/cluster 挂载目录，并执行df命令检查文件系统的磁盘空间占用情况。 （注意：系统重启后需重新挂载） abc@node2:~$ sudo mount -t nfs node1:/home/abc/cluster cluster （slave节点每次重启后需运行此挂载命令） abc@node2:~$ df 并执行df命令检查文件系统的磁盘空间占用情况。 8. 安装MPICH3并行计算环境 （1）安装前准备（node1和node2） 1) 使用命令可以查看当前编辑器的版本：(node1和node2) 从网上下载MPICH压缩包（mpich.tar.gz）：（node1） 2）图形模式：浏览器下载 /download 3）解压缩tar文件（node1）： abc@node1:~/cluster$ #tar xfz mpich-3.1.3tar.gz 系统自动生成解压目录/文件夹:mpich-3.1.3 4）创建mpich3.1安装目录 (/home/abc/cluste): （node1） 5）配置（node1）：Congure MPICH, specifying the installation directory, and running