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名词解释蛋白质工程通过对蛋白质已知结构和功能的了解,借助
名词解释:
蛋白质工程:通过对蛋白质已知结构和功能的了解,借助计算机辅助设计,利用基因定 点诱变等技术,特也行地对蛋白质结构基因进行改造,产生具有新的特性的蛋白质技术,并由此深入研究蛋白质的结构与功能的关系。
结构域:具有二级结构的多肽链,特别是长的多肽链在进一步折叠与盘曲形成三级结构时,可能组合成数个相互连续而又相对独立的疏密不等的区域,以执行某种特定的功能,这些区域称为结构域(domain)。
二维电泳:二维电泳是将不同种类的蛋白质按照等电点和分子量差异进行高分辨率的分离分析方法。
四级结构:是指在亚基和亚基间通过疏水作用等次级键结合成为有序排列的特定的空间 结构。
分子病:由于基因或DNA分子的缺陷,致使细胞内RNA及蛋白质合成出现异常、人体结构与功能随之发生变异的疾病。
盒式诱变 (Cassette Mutagenesis):是一种定点诱变技术,其方法是利用一段人工合成的具有突变序列的双链核苷酸片断,取代野生型基因中相应序列。
基因定点诱变:通过碱基取代、插入或缺失使基因DNA序列中任何一个特定碱基发生改变,是一种体外特异性改变某个碱基的技术。在DNA水平上,通过对蛋白质结构基因中某个或某些AA编码顺序加以改变,从而改变蛋白质结构的技术
IEF(等电聚焦):就是利用蛋白质分子或其他两性分子等电点的不同,在一个稳定、连续的线性梯度中进行蛋白质的分离。
模体:在许多蛋白质分子中,常发现几个(多为2(3个)具有二级结构的肽段相互靠近,形成具有特定功能的空间构象;或者仅是一个具有特定功能的很短的肽段。
蛋白质组:由一个基因组所表达的全部相应的蛋白质。或在一定条件下,存在于一个体系(包括细胞、亚细胞器、体液等)中的所有蛋白质。
穿织法:穿织法:也称蛋白质折叠指派(Protein Fold Assignment)或折叠辨识(Fold Recognition), 是将基因导出的蛋白质AA序列分配给与之最相匹配的蛋白质折叠模式,类似于将特定珍珠穿织在适配丝线上一样;进而将新的序列与其所属的维结构加以对比,进而有可能产生低分辨率的结构。
简答
一、蛋白质结构的基本结构组件 ?
1、天然常见氨基酸
2、肽单位和多肽链
3、α 螺旋
4、β层 (β折叠)
5、环肽链
6、疏水内核
二、蛋白质工程的基本程序:
三、现代质谱仪包括哪些?请写出质谱仪四个以上的组成部分。
快原子轰击质谱(FAB-MS)、电喷雾质谱(ESI-MS)、基质辅助激光解析电离质谱(MALDI-MS)
质谱仪由进样系统、离子源、质量分析器、检测器、记录系统、真空系统及计算机等部分组成。
四、稳定蛋白质三维结构的主要作用力有哪些?
稳定蛋白质三维结构作用力主要是一些弱的相互作用(或称非共价键或次级键),包括氢键,范德华力,疏水作用和盐键(离子键),二硫键, 水。
五、等电聚焦优点
(1)有很高的分辨率,可将等电点相差0.01~0.02pH单位的蛋白质分开;
(2)一般电泳由于受扩散作用的影响,随着时间和泳动距离加长,区带越走越
宽,而电聚焦能抵消扩散作用,使区带越走越窄;
(3)由于这种电聚焦作用,不管样品加在什么部位,都可聚焦到其等电点位置,很稀的样品也可进行分离。
(4)可直接测出蛋白质的等电点,其精确度可达0.01pH单位。
六、为什么说疏水内核是蛋白质稳定的基本结构因素
疏水性氨基酸残基的侧链以高度协调方式紧密堆积在蛋白质分子内部,它们几何形貌空间互补,形成蛋白质分子的疏水内核,疏水内核是推动以二级结构为基础的蛋白质分子骨架形成的重要因素,是蛋白质折叠的主要驱动力,天然蛋白质稳定的基本结构因素。蛋白质分子的低压缩性,在有机溶剂和强酸强碱中的变性等有关。
七、常用的蛋白质表达系统
根据被表达的基因和表达基因所用的系统可将表达分为四种:
(1)原核基因在原核细胞中的表达;(2)真核基因在原核细胞中表达
(3)原核基因在真核细胞中的表达;(4)真核基因在真核细胞中表达
八、常用的蛋白质N端序列分析仪
(1)液相旋转杯序列仪;(2)固相序列分析仪
(3)气相顺序仪 (4)新型蛋白测序仪
九、不连续电泳的不连续性有哪些?
聚丙烯酰胺凝胶电泳的四个不连续性
1)凝胶层的不连续性
2)缓冲液成分的不连续性:
3)pH的不连续性
4)电位梯度的不连续性
十、离子交换层析技术的优点?
(1)吸附容量大,具有开放性支持骨架,大分子可以自由进入和迅速扩撒
(2)温和的操作条件,蛋白和酶可保持活性,有亲水性
多孔性,表面积大,交换容量大,回收率高,可用于分离和制备。
十一、为什么说蛋白质结构域是蛋白质结构分类的依据?
结构域是蛋白质三级结构基本单位,可由一条多肽链(在单域蛋白中
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