生物化学上部复习提纲.docVIP

蛋白质化学 一、蛋白质的化学组成 二、蛋白质的基本单位——氨基酸 1、结构通式： 天然蛋白质中获得的氨基酸除Gly外均属L-氨基酸。 2、氨基酸的分类 3、蛋白质的一般理化性质 注：各种氨基酸均不吸收可见光；Phe、Tyr、Trp能显著吸收紫外光；旋光性 4、氨基酸的两性性质及等电点 氨基酸在水溶液或晶体状态是以两性离子形式存在，即在同一氨基酸分子上带有能放出质子的氨基正离子和能接受质子的羧基负离子的形式，因此，氨基酸是两性电解质。 由此可判断氨基酸的电荷状况及在电场中的行为。在等电点时氨基酸的溶解度、导电性、粘度及渗透性都最小。 氨基酸的等电点等于两性离子两侧基团pK值之和的一半。 对R基团不解离的中性氨基酸 pI=(pK1+pK2)/2 对R基团有解离的氨基酸： 酸性氨基酸：pI==(pK1+pKCOOH)/2 碱性氨基酸：pI==(pK2+pKNH2)/2 5、氨基酸的化学反应 1）?-NH2参加的反应 与甲醛、 HNO2、酰化反应和烃化反应（DNS、DNFB、PITC）及相应的反应条件；；脱氨反应；与酸成盐的反应 2）?-COOH参加的反应 与碱成盐反应；与醇成酯反应； 叠氮反应；脱羧反应；LiBH4反应 3）?-NH2和?-COOH共同参加的反应：注意茚三酮反应 4）侧链基团的反应 三、肽 肽、肽键、肽链、N端、C端、肽单位的概念 肽键的特点 肽的性质 四、蛋白质的结构 一）、构型与构象的区别 构型 构象 指不对称C原子上相连的各原子或取代基团的空间排布； 其改变涉及共价键的断裂。 指与碳原子相连的各原子或取代基团的单键旋转所造成的原子或基团在空间上的不同排布； 不改变共价键 二）蛋白质的结构层次 蛋白质的一级结构 一级结构的概念 一级结构的测定程序 请参见已发资料。 蛋白质的高级结构层次 二级结构的主要类型、各种类型的结构特点、结构稳定性因素及影响因素 超二级结构和结构域的概念、结构特点、结构稳定性因素 三级结构的概念、结构稳定性因素 四级结构的概念及结构稳定性因素 结构 维系结构的化学键 一级结构 肽键、二硫键（均为共价键） 二级结构 主链的氢键（?-螺旋为链内氢键；?-折叠为链间氢键） 超二级结构 结构域 三级结构 四级结构 二硫键（共价键） 侧链间次级键：氢键、离子键、疏水键、酯键、范德华力等 五、蛋白质的性质 1、亲水胶体性质：由于蛋白质带电荷和分子表面具水化膜 2、两性性质及等电点 蛋白质的沉淀反应：可逆性沉淀反应（盐析、pI、有机溶剂沉淀法）和不可逆沉淀反应（重金属盐沉淀、加热沉淀、生物碱沉淀等） 蛋白质的变性（变性作用、影响变性的因素及机理、变性的特征、复性等） 蛋白质的水解（酸、碱、酶水解，其中酶水解是重点）。 蛋白质序列测定中酶水解与化学法水解的催化部位和限制条件；N-和C-端测定的方法及基本原理（主要：Sanger 法和Edmann 降解法） 六、蛋白质的分类 七、蛋白质的分离与纯化 注意：电泳的基本原理、层析法（离子交换法等） 核酸化学 一、核酸的化学组成 注意区分DNA与RNA在组成上的区别 二、核酸的种类、分布及功能 三、核酸的结构 一）、核酸的一级结构 概念 核酸与蛋白质一级结构的比较 区别 蛋白质 核酸 基本结构单位 二十种氨基酸 4种相应的单核苷酸 连接的键 肽键 3`，5`-磷酸二酯键 链端 多肽链，具C端和N端 多核苷酸链，具3`端和5`端 主链的组成（不变部分） 由氨基N、?-C、羧基C原子反复循环组成，即-N-C?-C- 由戊糖+磷酸反复组成 侧链（可变部分） 二十种氨基酸残基的R基的不同排列组合 四种碱基的不同排列组合 二）、DNA的二级结构 1、DNA二级结构的的概念 DNA碱基组成的特点——Chargaff定律 DNA二级结构的典型结构——B-DNA双螺旋结构（Watson Crick模型，1953年）要点 2、DNA双螺旋结构与蛋白质α-螺旋的比较 比较内容 DNA双螺旋结构 蛋白质α-螺旋 结构类型 核酸的二级结构 蛋白质的二级结构 骨架 二条右旋的核苷酸链，绕同一中心轴反向平行排列； 磷酸和脱氧核糖的重复 一条右旋的肽链 -N-Cα-C-的重复 直径 20? 5? 螺圈 每10个核苷酸上升一圈 每3.6个Aa上升一圈 螺距 34? 5.4? 间距及夹角 核苷酸间距3.4 ? 沿中轴转36° 氨基酸残基的间距1.5 ?(5.4 ? /3.6 Aa) 沿中轴转100° 稳定力 碱基堆积力、氢键、离子键 主链内氢键 链端 5`端和3`端 N端和C端 三）其他DNA螺旋的结构 回文结构——DNA序列中以某一中心区域为对称轴，其两侧的碱基对顺序正读和反读都相同的双螺旋结构，即