宏基因组技术在微生物中的应用专用课件.pptVIP

宏基因组技术在微生物中的应用 蒋超 4031031182 1.宏基因组概述 2.环境宏基因组学基本技术 3.环境宏基因组学技术的主要瓶颈 1.宏基因组概述1.1.微生物资源开发应用的新途径 据估计每克土壤样品中可含有高达4,000种的不同微生物，1g土壤就包含6. 1×107个基因。 传统途径—培养途径 开发环境微生物基因资源较为传统的研究途径是:分离微生物,获得纯培养,基因表达产物活性检测、活性物质的分离纯化直至开发利用。这一途径被证明是十分有效的,也获得了诸多有应用价值的活性物质。但是,环境中仅有0. 1% ~1%的微生物能够采用现有培养技术进行分离培养,在今天采用传统培养方法已很难发现新的活性物质,极大地限制了未培养微生物基因资源的开发利用。 新途径—宏基因组途径 近年来发展起来的宏基因组克隆技术,直接提取环境样品核酸进行遗传操作,避开了微生物分离培养问题,极大地扩展了微生物资源的利用空间。已在土壤生态环境、海洋生态环境和各种极端环境中开展应用。 1.2.宏基因组定义 “1998年Handelsman等首次提出宏基因组的概念。一种以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象,以功能基因筛选和测序分析为研究手段,以微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系、及与环境之间的关系为研究目的的新的微生物研究方法。 宏