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IPP使用总结
TOC \o 1-3 \h \z \u HYPERLINK \l _Toc359356309 重要定义 PAGEREF _Toc359356309 \h 1 HYPERLINK \l _Toc359356310 转换光密度单位的方法如下 PAGEREF _Toc359356310 \h 1 HYPERLINK \l _Toc359356311 AOI技巧(灰度值、面积测量) PAGEREF _Toc359356311 \h 2 HYPERLINK \l _Toc359356312 编制宏 PAGEREF _Toc359356312 \h 4 HYPERLINK \l _Toc359356313 计数 PAGEREF _Toc359356313 \h 8 HYPERLINK \l _Toc359356314 图象分析策略 PAGEREF _Toc359356314 \h 11 HYPERLINK \l _Toc359356315 图片的保存 PAGEREF _Toc359356315 \h 13 HYPERLINK \l _Toc359356316 光密度 PAGEREF _Toc359356316 \h 13 HYPERLINK \l _Toc359356317 关闭相机的自动白平衡功能 PAGEREF _Toc359356317 \h 15 HYPERLINK \l _Toc359356318 免疫组化光密度测量 PAGEREF _Toc359356318 \h 16 HYPERLINK \l _Toc359356319 统计问题 PAGEREF _Toc359356319 \h 21 HYPERLINK \l _Toc359356320 宏操作 PAGEREF _Toc359356320 \h 22转换光密度单位 → 选好待测量的区域 → 指定测量项目 → 进行测量统计重要定义:①把图片中呈现黄色的区域给挑选出来,这部分区域是我们最感兴趣的地方,叫作AOI(area of interest)②图片中被标上红色的区域被定义为一个class,其中每一个独立的小区块被定义为这个class中的一个object。以此图为例,图中深蓝色的部分是细胞核,因此所有的细胞核都被选中成一个class,其中每一个细胞核就是一个object③在默认的intensity格式中,是图片灰度,越黑数值越小,越白数值越大。而实际上我们测量的染色强度是光密度,染色越深,光密度值越大。需要进行转换图象intensity格式,如果不进行光密度单位的转换,测量的数值将完全是错误的。转换光密度单位的方法如下:点击:measure--carliberation--intensity,调出intensity校正窗口。然后在窗口中点new按纽,再点一下下面的std optical density选项,这时可以看到窗口中的直线变成了反向的曲线。然后还要点一下最上面的system按纽。最后点close关闭窗口。这样就把程序系统的灰度单位转换成了光密度单位。将光密度单位设定为system之后就不必再对后面的每一张照片都进行光密度校正了。AOI技巧(灰度值、面积测量):(1)segmentation工具:面对组织切片中密密麻麻的细胞,就得用本主题讨论的segmentation工具。正确的操作顺序是:先打开select measurement,选择好各个测量项目,再回到count/size中点select color进行颜色选取,再回到count/size窗口中点count计数。这样操作结束后仔细观察一下计算的区域,正是刚才正确选取的区域了。①点measure的select measurement ,选中area, density(mean),IOD。②选manual,并点select color调出segmentation窗口。窗口里有两个表单,一个是color cube based,另一个是histogram based。我们要选取后者,并且使用HSI颜色格式来进行分色选择。当切换到HSI时,会弹出一个窗口提示你会reset颜色选择,是否继续?当然是OK啦。这时的颜色选择全部重置为0-255。在HSI颜色格式中,H为色调,就是我们眼睛所看到的红橙黄绿青蓝紫等。S为色饱和度,I为强度。在选择AOI时,首先保持S、I为最大范围,从H中选择黄色部分。点一下H,直方图显示就是图片各象素H值的分布,在直方图的两边各有一根线,这就是选择线,先将右边的线用鼠标左键向里面拉,拉一点停一下看看效果,可以看到最开始时是选中了全部画面,然后是蓝色的区域慢慢显露出来,并且越显越多,选择线的位置也在下面的窗口中有显示,是0-255之间的数,共有两个窗口,左边是取值下
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