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果汁及果汁制品中脂环酸芽孢杆菌的快速测定吉林省地方标准
前 言
本标准的附录A为规范性附录,附录B为资料性附录。
本标准由吉林省质量技术监督局提出并归口。
本标准主要起草单位:吉林省产品质量监督检验院。
本标准主要起草人:史艳宇,刘俊会,华蕾,安伟,李媛媛,逄晓阳,王莹,王伟,李刚等。
本标准系首次发布的地方标准。
果汁及果汁制品中脂环酸芽孢杆菌的快速检测--荧光PCR方法
范围
本标准规定了方法。
GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法。
定义、术语和缩略语PCR:polymerase chain reaction,简称PCR。
3.2.2 DNA:deoxyribonucleic acid,脱氧核糖核酸。
3.2.10 Ttis: tris(hydroxymethyl)aminomethane,三(羟甲基)氨基甲烷。
3.2.11 Ct值:每个反应管内的荧光信号达到设定的阈值时所经历的循环数。TaqMan方法,在比对脂环酸芽孢杆菌16S r RNA基因序列的基础上,设计针对该基因的特异性引物和特异性的荧光双标记探针。探针5’端标记FAM荧光素为报告荧光基团(用R表示),3’端标记TAMRA荧光素为淬灭荧光基团(用Q表示),它在近距离内能吸收5’端荧光基团发出的荧光信号。PCR反应进人退火阶段时,引物和探针同时与目的基因片段结合,此时探针上R基团发出的荧光信号被Q基团所吸收,仪器检测不到荧光信号;而反应进行到延伸阶段时,Taq酶的5’→3’的外切核酸酶功能将探针降解。这样探针上的R基团游离出来,所发出的荧光不再为Q所吸收而被检测仪所接收。随着PCR反应的循环进行,PCR产物与荧光信号的增长呈现对应关系。
试剂和材料
除特别说明以外,本标准所用试剂均为分析纯5’- CGTAGTTCGGATTGCAGGC -3’
5’- GTGTTGCCGACTCTCGTG -3’
探针
5’-FAM-CGGAATTGCTAGTAATCGC-TAMRA-3’
5.4 Taq DNA聚合酶。
5.5 dNTP:dATP、dCTP、dGTP、dTTP。
5.6 DNA提取试剂:0.1%Chelex100水溶液。
5.7 10×PCR缓冲液:200 mmol/L Tris-HCl(Ph8.4),200 mmol/L氯化钾,15 mmol/L氯化镁。
5.8 脂环酸芽孢杆菌质控菌株:ATCC 49025。
6 仪器和设备
6.1 荧光PCR仪。
6.2 离心机微量移液器10 μL、 μL、00 μL、1 000 μL。
6.4 水浴锅。
7 检验程序
图1 荧光PCR检测脂环酸芽孢杆菌程序图
8 步骤
8.1 取样和增菌
取样前消毒样品包装的开启处和取样工具。以无菌操作取样品25 mL (g),加在225 mL的K液体培养基中,振摇使样品充分混合后,47℃恒温振荡培养24 h~48 h。
模板DNA准备
取增菌液1 mL加到1.5 mL无菌离心管中,8 000 r/min离心5 min,尽量吸弃上清液;加入50 μL DNA提取液(使用前室温解冻并充分混匀,快速吸取),混合后沸水浴5 min,12 000 r/min离心5 min,取上清液以待检测(如不能及时检验,可将上清液于-20℃保存)。
也可按细菌基因组DNA提取试剂盒操作说明书提取模板DNA。
荧光PCR检验
反应体系总体积为25 μL,其中含:10×PCR缓冲液2.5 μL、引物(10 μmol/L)各1μL、探针(10 μmol/L)1μL、dNTP(10 mmol/L)1μL、Taq DNA聚合酶(5 U/μL)0.5 μL、水16 μL、模板DNA 2 μL。反应步骤一:95℃预变性3 min。反应步骤二:95℃变性30 s,55℃退火延伸30 s,同时收集FAM荧光,共进行40个循环。反应产物可在4℃保存。
检验过程中分别设阳性对照、阴性对照。脂环酸芽孢杆菌DNA作阳性对照,以灭菌水作为阴性对照。
9 结果与判断
检验样品Ct值小于或等于35.0时,报告脂环酸芽孢杆菌筛选阳性;样品Ct值大于35.0且小于40.0时,重复一次,如果Ct值仍小于40.0,且曲线有明显的对数增长期,可报告脂环酸芽孢杆菌筛选阳性,否则报告脂环酸芽孢杆菌未检出;样品检测不到Ct值时,报告脂环酸芽孢杆菌未检出。
10 废弃物处理和防止污染的措施
检验过程中的废弃物,收集后在焚烧炉中焚烧处理。
检验过程中防止交叉污染的措施见附录B。
附 录 A(规范性附录)K液体培养基制作
A.1 成分
蛋白胨 5.0 g
酵母提取物 2.5 g
葡萄糖 1.0 g
吐温-80
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