计算机在生命科学中的应用第四作业3.docVIP

计算机在生命科学 中的应用报告 对硫磺矿硫化叶菌p216srRNA80-709碱基片段进行PCR扩增分析报告 前言：目前对目的基因片段进行扩增主要通过聚合酶链式反应（PCR）来完成，扩增需要模板、引物、四种脱氧核糖核苷酸、DNA聚合酶、反应缓冲液等成分，包括变性、退火和延伸三个步骤。 扩增之前，我们需要对目的基因所在的片段进行分析，找到合适的引物、模板及适当的反应体系，然后对目的基因进行大量扩增。 正文：我们要对硫磺矿硫化叶菌p216srRNA80-709碱基片段进行大量扩增，完成这一目的主要包括以下几个步骤： 对目的基因所在的DNA序列进行酶切分析。 将酶切后的DNA序列进行电泳，找到目的基因所在片段。 对目的基因所在片段进行分析，找到合适的引物及反应条件 对目的基因进行扩增。 用到古生菌的序列长12389bp，其中80-709bp是我们需要的未知功能蛋白质的基因序列，利用Vector NTI Explorer进行分析。 结果如下： 上图即为目的基因所在的DNA序列的酶切分析，由上图可以看出在第980个碱基处，有两个酶切位点，两种酶分别是BstiZ316I和AdeI，并且这两种酶在整个DNA序列上的酶切位点是唯一的。选其中一种酶（此处选择的是酶AdeI）对目的基因