SNP分子标记原理和应用.pptVIP

6.DNA测序法 直接测序是最容易实施的SNP检测方法。 原理: 通过对不同个体同一基因或基因片段进行测序和序列比较, 以确定所研究的碱基是否变异, 其检出率可达100%。 特点：可以得到SNP 的类型及其准确位置等SNP分型所需要的重要参数。 7.飞行质谱仪 (MALDI- TOFMS )检测 原理：是将变性的单链PCR产物通过与硅芯片上的化合物共价结合后, 在硅芯片上进行引物的退火,延伸反应, 突变部位配对的碱基与正常配对的碱基不相同。根据引物在延伸反应中所结合的不同碱基的不同质量在质谱仪上显示不同峰而检测SNP。 SNP分型的方法多种多样，MassARRAY分子量阵列技术是Sequenom公司推出的世界上领先的基因分析工具，通过引物延伸或切割反应与灵敏、可靠的MALDITOF质谱技术相结合，实现基因分型检测。 基于MassARRAY? 分子量阵列平台的iPLEX GOLD技术可以设计最高多达40重PCR反应和基因型检测，实验设计非常灵活，分型结果准确性高。特别适合于对全基因组研究发现的结果进行验证，或者是有限数量的研究位点已经确定的情况。 MassARRAY技术原理: 先通过PCR扩增目标序列，然后加入SNP序列特异延伸引物，在?SNP?位点上，延伸?1个碱基，在反应体系中以ddNTP替代dNTP，使探针仅在SNP位点处延伸一个碱基即终止。根据SNP位点的不同，探