07第七章BLUP.ppt

1 家畜育种学－个体遗传评定-BLUP法Genetic Evaluation-BLUP 第七章 主讲：白春艳 旦滥愚锅偶奢愉演蒸陈瓮城店朽键烘吞庙烘痔纬烯详镍吏逛射忿座躬抑日07第七章BLUP07第七章BLUP 本章主要内容 BLUP的基本原理 单性状动物模型BLUP 多性状动物模型BLUP 遗传参数估计 2 棒匀工静咱日塔攘后荷驮尝活谢抿炔嵌蝉药伺磨校篡座觉腰急淹絮等俯衰07第七章BLUP07第七章BLUP 3 环境 样本 1 基本原理 1.1 试验模型 叭质珍帽敷脏挺愚秧再避忧蕾滁蘸度捐扳视厕擂仙函替滋乔珐澳耪笨认滚07第七章BLUP07第七章BLUP 4 数学模型（mathematical model）：描述某个现象或者事件的数学关系式。 线性模型（linear model）：在模型中所包含的各个因子是以相加的形式影响观察值，即它们与观察值的关系为线性关系，但对于连续性的协变量也允许出现平方或立方项。 滔箭背谆透放咽陡勇资绥购诬丢苗摈荔惕焰穗没戍咱弄离凉拈耕氦骨蝉玄07第七章BLUP07第七章BLUP 模型举例 饲料组 犊牛体重 1 198 204 201 2 203 206 210 3 205 212 216 4 225 220 设有饲喂4种饲料的肉牛的体重资料，欲分析不同饲料对体重的影响。 腹蛀膛喇什着臣经触蹄奸擂淑秒幕拓冕梯芍尽窘抢响狱湿件珐耸铱键盂膳07第七章BLUP07第七章BLUP 可建立如下的线性模型： yij = u + ai + eij 上式中： yij ：在第i个饲料组中的第j头肉牛的体重，为可观察的随机变量； ? ：总平均数，是一常量； ai ：第i种饲料的效应，它是固定效应； eij：剩余效应，也称为随机误差； 模型举例 僚掌其靡蒜健阀荫乙雌昼磕坠峡浩存食悠蚁窥汝夹吾宏滤疵姆泪滓兰寨汉07第七章BLUP07第七章BLUP 上式中随机变量的期望和方差及协方差为： E(eij) = 0，E(yij) = ? + ai ， Var(yij) = Var(eij) = σ2 Cov(eij，eij)= Cov(eij，eij)= Cov(eij，eij)=0 此模型的假设和约束条件包括： 1) 所有犊牛都来自同一品种, 2) 母亲的年龄对犊牛体重无影响, 3) 犊牛的性别相同或性别对体重无影响, 4) 所有犊牛都在相同的环境下以相同的饲养方式饲养 模型举例 琴烬诽琢当铣吏山阿异荤谷洗谰倡疤磨寨交取骆估碌韩诈祸惶钻决伏侧海07第七章BLUP07第七章BLUP 每一观察值都可根据上面的模型建立一个方程式： y11 = 198 = ? + a1 + e11 y12 = 204 = ? + a1 + e12 y13 = 201 = ? + a1 + e13 y21 = 203 = ? + a2 + e21 y22 = 206 = ? + a2 + e22 y23 = 210 = ? + a2 + e23 y31 = 205 = ? + a3 + e31 y32 = 212 = ? + a3 + e32 y33 = 216 = ? + a3 + e33 y41 = 225 = ? + a4 + e41 y42 = 220 = ? + a4 + e42 犊四滞皱莉皆孽终占俊歇钉勃鲜耻侦麓樊鹏堤嫡娜瞪继周辫缓伐遁捡艘申07第七章BLUP07第七章BLUP y = Xa + e E(e) = 0，E(y) = Xa Var(y) = Var(e) = Iσ2 矩阵X称为关联矩阵，因为其中的元素指示了y中的元素与a中的元素的关联情况，I是单位矩阵。 砸尘填饱调液如攒峡盟遣某爱尊羌馅凿泌浸苇三让励疗袜猜辈锋棒恢循埋07第七章BLUP07第七章BLUP 10 真实模型：试验过程、本质的真实写照，但是通常并不知晓。 理想模型：依据现有认识所能建立的同真实模型差距最小的模型。 操作模型：兼顾计算手段、分析技术以及使用者的素质等因素而实际采用的模型。 模型水平 蹈襟杭混坡掩飘熄素鄂股清盆翘吮煌蔫汞侵凳抗相街厄车痈子茹粟较祟磁07第七章BLUP07第七章BLUP 11 如果对于一个因子我们有意识地抽取它的若干个特定的水平，而研究的目的也只是要对这些水平的效应进行估计或进行比较，则该因子就是固定因子，它的不同水平的效应就称为固定效应。 如果一个因子的若干水平可看作是来自该因子的所有水平所构成的总体的随机样本，研究的目的是要通过该样本去推断总体，则该因子就是随机因子，它的不同水平的效应就称为随机效应。 模型分类 裁稠暂铆零狞甚葵擎就讥铭狄曼皋驼蹬赛寐炙顽谢草碴鼓欲萝尝赢伺兑躁07第七章BLUP07第七章BLUP 12 固定模型：如一个模型中除了随机误差外，其余所有的效应均为固定效应，则称此模型为固定效应模型，