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液态活检在肿瘤研究的现状和趋势分析
内容概括
液态活检概念
循环肿瘤细胞及其核酸
游离肿瘤核酸
组织活检的局限性
很多肿瘤患者无法进行手术
穿刺受检者严重的不合适
穿刺自身的临床风险
某些肿瘤解剖位置不便进行穿刺
肿瘤的异质性
阿拉伯医生Albucasis (936-1013)及其发明的外科手术器械
Folia Histochem Cytobiol. 2009年47卷2期191-7页
液态活检(liquid biopsy)
循环肿瘤细胞(Circulating tumor cell,CTCs)
游离肿瘤DNA( Circulating tumor DNA,ctDNA或者 Circulating Free DNA,cfDNA)
血检
CTC
CTC—转移过程中必经阶段
CTC:
是否是介导肿瘤转移的细胞?
J Clin Oncol. 2009;27(20):3303-3311
J Clin Oncol.?2008;26(19):3213-21
Clin Cancer Res.?2008 ;14(19):6302-9
CTC的生物学功能
Circulating Tumor Cell Clusters
Are Oligoclonal Precursors of Breast Cancer Metastasis
Tumorigenicity and genetic profiling of circulating tumor cells in small-cell lung cancer Nat Med.?2014?;20(8):897-903
Cell Rep.?2014?Sep 25;8(6):1905-18
Cell.?2014 28;158(5):1110-22
Single-cell RNA sequencing identifies extracellular matrix gene expression by pancreatic circulating tumor cells
CTC检测方法
与血液细胞相比,肿瘤细胞具有以下特征:
体积更大;
液相流动性更大;
细胞膜的电容和电导特性不同;
CTC确认标准:
DAPI染色阳性;
组织来源相关CK染色阳性;
CD45染色阴性;
肿瘤相关抗原染色阳性
(MUC1,HER2,PSA
et al.)
其它辅助方法:FISH , H?E,PCR , EPISPOT
EMBO Mol Med. 2015 Jan; 7(1): 1–11
CTC临床治疗?治疗决策
预后预测不应只是一切的终点,而应是一切的开始
虽然CTC对接受一线化疗的转移性乳腺癌患者预后具有重要意义,但是针对一线化疗后CTCs仍升高的患者换用其它化疗方案并不能有效地延长患者生存期。
Circulating?tumor?cells?and?response?to?chemotherapy?in?metastatic?breast?cancer:?SWOG?S0500
CTC的分子特征
Solidifying?liquid?biopsies:can?circulating?tumor?cell?monitoring?guide treatment selection in breast cancer?
CTC的简单计数,并不能反应肿瘤细胞内在的生物学特性,而正是这种特性是决定了不同的肿瘤细胞对治疗具有不同的反应。因此,对CTC细胞的分子特性(例如药物靶向基因的表达,药物耐受相关基因突变的检测)的精细刻画,将有利于充分发掘CTC在指导临床治疗的价值。
?Treat—CTC: Trastuzumab?in?HER2-negative?Early?breast?cancer?as?Adjuvant?Treatment?for?Circulating?Tumor Cells??
在CANCER RESEARCH 全文下载不到
CTC—单细胞测序
Method of the Year 2013
Multiple Annealing and Looping Based Amplification Cycles(MALBAC)
multiple displacement amplification(MDA)
MDA扩增方法优点:
不引入接头序列
SNV假阳性率较低
(—0.001%)
数据不易受外源DNA污染影响
MALBAC扩增方法优点:
拟线性扩增,适合CNV分析;
数据重现性较好
CTC—单细胞测序优势
Whole-exome sequencing of circulating tumor cells provides a window into metastati
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