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限制性内切酶(restriction endonuclease) 简称限制酶 : 限制性内切酶主要降解外源的未经特殊修饰的DNA,对自身起了保护作用。 限制性内切酶的特征 ① 具有严格的碱基专一性,有专一的识别顺序、切点 ② 粘性未端,平整末端 DNA分子中核苷酸的排列顺序: 酶法(双脱氧法、末端终止法) 基因和基因组 基因即一段有功能的DNA片段,生物细胞中DNA分子的最小功能单位(交换单位)。 一个细胞或生物体所含的全套基因称基因组; 基因组计划: 人类基因组计划(Human Genome Project, HGP ) 酵母基因组计划 (YGP) 大肠杆菌(E.Coli) 真核生物基因组的特点 A. 重复序列 单拷贝序列:在整个DNA中只出现一次或少数几次,主要为编码蛋白质的结构基因。 中度重复序列:在DNA中可重复几十次到几 千次。 高度重复序列:可重复几百万次 高度重复序列一般富含A-T或G-C,富含A-T的在密度梯度离心时在离心管中形成的区带比主体DNA更靠近管口;富含G-C的更靠近管底,称为卫星DNA(satellite DNA) 富含A-T 富含G-C 主体DNA B. 有断裂基因 mRNA 1 872bp 内含子(intron):基因中不为多肽编码,不在mRNA中出现。 A B C D E G 7 700bp F 外显子(exons):为多肽编码的基因片段。 :由于基因中内含子的存在。 transcription 原核生物基因组的特点 A. DNA大部分为结构基因,每个基因出现频 率低。 B. 功能相关基因串联在一起,并转录在同一mRNA中(多顺反子)。 C.有基因重叠现象。 A B C D E F G 五、 RNA的分子结构 1 RNA的一级结构 2 tRNA 的分子结构 3 rRNA的分子结构 4 mRNA的分子结构 RNA分子中各核苷之间的连接方式(3′-5′磷酸二酯键)和排列顺序叫做RNA的一级结构 OH OH OH 5′ 3′ RNA与DNA的差异 DNA RNA 糖 脱氧核糖 核糖 碱基 AGCT AGCU 不含稀有碱基 含稀有碱基 1 RNA的一级结构 转运RNA,即tRNA,它的一端可以共价连接一个氨基酸,在蛋白质合成过程中起转运氨基酸的作用。 * tRNA的一级结构特点 含 10~20% 稀有碱基,如 DHU 3′末端为 — CCA-OH 5′末端大多数为G 具有 T?C tRNA 的结构 二级结构特征: 单链三叶草叶形 四臂四环 三级结构 特征: 在二级结构基础上进一步折叠扭曲形成倒L型 X光晶体衍射解出的 tRNA 立体结构 tRNA的三级结构 核糖体RNA即rRNA,是细胞内含量最多的RNA,约占RNA总量的80%以上,是蛋白质合成机器—核糖体的组成成分。 在rRNA分子中,研究最多的是5SrRNA和16SrRNA。大肠杆菌中的5SrRNA的5 ’-端常出现pppU,3 ’-端为UOH ;第43-47位的核苷酸顺序为CGAAC(真核细胞此序列则出现在5.8SrRNA),这是rRNA与tRNA相互识别、相互作用的部位;原核细胞16SrRNA的3 ’-端总存在序列ACCUCCU,这是mRNA的识别位点。 rRNA的分子结构 特征:? 单链,螺旋化程度较tRNA低 ? 与蛋白质组成核糖体后方能发挥其功能 5SRNA的二级结构 信使RNA即mRNA,为单链结构,约占RNA问题的5-10%,在合成时转录模板DNA所携带的遗传信息。 mRNA相对分子质量不均一,代谢活跃,这给一级结构的研究带来一定困难。真核细胞mRNA与原核mRNA比较,在结构上具有明显的区别。真核细胞mRNA的3 ’-末端有一段可长达200个左右的聚腺苷酸(poly A),称为“尾”结构;5 ’-末端有一个甲基化的鸟苷酸,称为“帽”结构,表示m7Gp5p5pXpmY,其中X、Y为任意碱基。这种“尾”和“帽”的结构在mRNA功能表现中具有重要作用。 mRNA的分子结构 原核生物mRNA特征: 先导区+翻译区(多顺反子)+末端序列 真核生物mRNA特征: “帽子”(m7G-5′ppp5′-N-3′p)+单顺反 子+“尾巴”(Poly A) 原核细胞mRNA的结构特点 5′ 3′ 顺反子 顺反子 顺反子 插入顺序 插入顺序 先导区 末端顺序 真核细胞mRNA的结构特点
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