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三、非核糖体聚肽类 由非核糖体肽链合成酶(nonribosomal peptide synthetases，NRPSs)催化生成的。NRPSs由多个模块按特定的空间顺序排列而成，模块由结构域构成。每一模块负责一个氨基酸单体的引入，每一结构域负责一类特殊的催化反应。大多数NRPSs的模块数为3~15个，最高可达50个。一个完整的反应需要4个主要的结构域：第一个是腺苷酰化(adenylation，A)结构域，选择并激活氨基酸单体成腺苷酸形式；接着是巯基化（thiolation，T）结构域或肽酰载体蛋白(peptidyl carrier protein，PCP)结构域，将活化后的腺苷酸形式与酶接合；第三是缩合(condensation，C)结构域，催化形成肽键并连到相邻两个模块上；最后是硫酯酶（thioesterase，TE）结构域，只出现在最后模块中，从酶中释放出多肽。 Aminoadipyl-cysteinyl-valine synthetase (ACVS), a NRPS biosynthesizing the precursor of penicillins and cephalosporin. AAad, aminoadipoyl adenylase; ACys, cysteine adenylase; AVal, valine adenylase; C, peptide-condensing enzyme 在NRPSs中也发现其它的合成后修饰结构域，如导致某些氨基酸D-异构化的差向立体异构结构域，还有甲基化、氧化、酰基化、糖基化及环化结构域。NRPSs就表现出氨基酸构成的多样性。目前的NPRS可归纳为3类：即线性NPRSs(A型)，重复型NPRSs(B型)和非线性NPRSs(C型)三类。线性NPRSs中，三个核心的结构域以C-A-T的顺序在模块上排列，催化氨基酸逐步结合到合成中的肽链中。重复型NPRSs在组装过程中多次重复利用共线性生物合成。非线性PRSs的显著特征就是核心结构域C，A和T中至少有一个异常排列。 PCP,peptidyl carrier protein. Epim, epimerase; NMet, N-methyl transferase; Cy, cyclase NPRS的组合生物合成 PKS/NRPS生物合成途径 Cryptophycins是一类16元大环结构的缩酚酸肽类化合物，从蓝绿藻念珠藻属(Nostoc sp. ATCC 53789或Nostoc sp. GSV 224)中提取获得，该类化合物可通过抑制微管聚合达到较高的抗肿瘤作用。Cryptophycin 1是cryptophycins家族的代表产物，由4部分组成：苯辛烯酸(unit A)、3-氯-O-甲基-D-酪氨酸(unit B)、甲基丙氨酸(unit C)和L-亮氨酸(unit D)。 Antihelminthic：抗虫 * 如在负责青霉素生物合成的模块3中, 将决定底物特异性的腺苷化功能域底物是半胱氨酸替换负责抗生素surfactin化合物生物合成的模块7中的功能域底物是亮氨酸, 获得的突变菌株则产生相应位置半胱氨酸取代亮氨酸的类似物图, 化合物在保证读码框不变的前提下将模块2缺失后获得的突变体产生相应位置亮氨酸缺失的缩环产物, 化合物。在大量统计和分析的基础上, 总结出了A中决定功能域对应相应底物的关键氨基酸残基, 进而证实通过定点突变改变这些关键氨基酸可以改变功能域的底物选择性。例如定点突变的A模块功能域的底物识别关键氨基酸, 使其底物选择性由原来的门冬氨酸转变为门冬酰胺, 获得的突变菌株则产生相应位置氨基酸改变的类似物 * CHINA PHARMACEUTICAL UNIVERSITY 组合生物合成 一、定义 组合生物合成（Combinatorial Biosynthesis）： 是在微生物次级代谢产物生物合成基因和酶学基础上形成的, 通过对微生物代谢产物合成途径中涉及到的一些酶的编码基因进行操作(如替换、阻断、重组等)来改变生物合成途径产生新的代谢旁路, 利用天然产物生物合成机制获得大量新的“非天然”天然产物的方法。 1985 年, Hopwood 教授在世界首次报道用遗传工程的手段合成“非天然”的天然产物isochromanequinone, 为后来的组合生物合成奠定了基础。这一领域成为天然产物代谢工程研究中最活跃的领域, 许多微生物次级代谢研究的专家都加入这一领域的工作, 因为组合生物合成有潜力制造出很多先导化合物。 美国加州高新技术产业公司研制的埃波霉素(epothilone) 作为抗肿瘤药物于2007年上市。霉素原来由纤维堆囊黏细菌产生, 其产量低, 繁殖时间长, 产品无法进行产业化生产。