生物化学和分子生物学4幻灯片.pptVIP

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基因与基因组测序 什么是基因组 基因组就是一个物种中所有基因的整体组成。 基因组有两层意义:遗传物质和遗传信息。 要揭开生命的奥秘,就需要从整体水平研究基因的存在、基因的结构与功能、基因之间的相互关系。 水稻的基因组 2002年我国科学家完成了水稻基因组定序和初步分析。出人意表的是,水稻的基因竟比人类基因还要多得多。人类基因大约有3-4万个,水稻有46022-55615个基因。因此水稻基因组可说是继人类基因组之后,完成定序的最大基因组,也是至今已知最大的植物基因组。由于水稻是全球半数以上人口的主食,对解决全球粮食问题具有重要意义。 人类基因组计划 人类基因组计划(Human genome project)于1990年启动,我国于1999年加入该计划,承担其中1%的任务,即人类3号染色体短臂上约30Mb的测序任务。 人类基因组计划的目的 阐明人类基因组30亿个碱基对的序列,发现所有人类基因,并搞清其在染色体上的位置; 破译人类全部遗传信息,使人类第一次在分子水平上全面地认识自我; 解码生命、了解生命的起源、了解生命体生长发育的规律; 认识种属之间和个体之间存在差异的起因、认识疾病产生的机制以及长寿与衰老等生命现象、为疾病的诊治提供科学依据。 人类基因组计划的意义   随着人类基因组逐渐被破译,一张生命之图将被绘就,人们的生活也将发生巨大变化。人类基因研究的意义在于它可以支持和推动生命科学中一系列重要的基础性研究。如基因组遗传语言的破译,基因的结构与功能关系,生命的起源和进化,细胞发育、生产、分化的分子机理,疾病发生的机理等。 两种策略的比较 鸟枪法策略 指导测序策略 不需背景信息 构建克隆群 (遗传、物理图谱) 时间短 需要几年的时间 需要大型计算机 得到的是草图(Draft) 得到精细图谱 DNA测序的方法 化学降解法测序 链终止法测序 自动化测序 非常规DNA测序 Maxam-Gilbert 法所用的化学技术 后人类基因组计划 伴随着人类基因组计划的迅速进展,基因的全序列逐步被完整的测出,会出现大量的不知道任何功能信息的序列。因此,在HGP完成之后,即全部人类基因被定序之后,还需要: 破解贮存于基因组之中的遗传语言; 识别、分离、鉴定和克隆所有基因; 搞清每个基因的功能及基因之间的相互作用和相互关系。 2000年是基因组之年,完成了人类基因组的工作框架图,完成了一系列模式生物和微生物的基因组序列分析。 人类后基因组时代的特点 人类首次了解了自身的基因序列,了解了很多远亲生物的基因序列 人类正在面对指数扩增的基因序列资料和各种数据库 人类面临的挑战是如何将基因序列资料转变为有用的知识,进而让这些知识服务于人类,使之能够造福于人类的健康。 后基因组时代研究的重要方向 1.单基因遗传病的致病基因研究和基因诊断 我国有丰富的疾病资源,特别是一些我国特有的单基因遗传病家系,可提供良好的基础发现新的致病基因. 2.复杂性疾病的相关基因研究和疾病易感性分析 在复杂性疾病的中,由于基因的变异加环境和生活习惯等因素的共同影响,使得每个人对不同的疾病的易感性不同。 3.药物基因组学研究与个体化治疗 在临床上对同样一种疾病使用同一种药物,不同的个体对药物的敏感性和毒性反应有很大的区别,这种区别主要由基因决定的,特别是药物靶点基因、药物代谢基因等的单核苷酸多态性,影响了药物作用的强弱和药物代谢的不同。 4.人类功能基因组学研究 以全基因组为背景,开展人类基因及其编码蛋白的功能研究。 目前虽然完成了绝大部分基因的序列分析,但约60%的人类基因的功能未知。目前认为人类有3.2万个基因,其中1.5万已知功能,1.7万未知功能。 5.基于基因组的新型药物(Genome-based drug) 利用反向生物学原理,根据人类基因序列 数据,经生物信息学分析、高通量基因表 达、高通量功能筛选和体内外药效研究开 发得到的新药候选物。 人类基因组为药物开发提供了新源泉 迄今已应用的人类药物靶标约500种,包括受体、酶、信号转导分子等。开发成功的药物约2000种。 估计人类基因组中3-4万个基因中,约5000个基因产物可成为潜在的药物靶标 6.基因治

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