革兰阳性球菌课件.pptVIP

(2) 核酸的分子杂交 不同生物DNA碱基排列顺序的异同直接反映生物之间亲缘关系的远近，碱基排列顺序差异越小，它们之间的亲缘关系就越近，反之亦然。 核酸分子杂交(hybridization)——间接比较不同微生物DNA碱基排列顺序的相似性 a）DNA-DNA杂交； （亲缘关系相对近的微生物之间的亲缘关系比较） b）DNA-rRNA杂交； （亲缘关系相对远的微生物之间的亲缘关系比较） c）核酸探针； （利用特异性的探针，用于细菌等的快速鉴定） (3) 16SrRNA或18SrRNA的核酸序列分析 16SrRNA被普遍公认为是一把好的谱系分析的“分子尺”： 16SrRNA的序列高度保守，可精确指示细菌之间的亲缘关系 16SrRNA的大小为1540bp左右，所含信息能反映生物界进化关系，易操作，适用于各级分类单元 目前常用的是建立在PCR技术基础上的16SrRNA基因的直接测序法，方便快捷。 菌种鉴定工作三部曲 1、获得该微生物的纯培养 2、测定一系列必要的鉴定指标 3、查找权威性鉴定手册 7、微生物分类系统 《伯杰氏鉴定细菌学手册》 (Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology) 美国宾夕法尼亚大学的细菌学教授伯杰(D.Bergey)(1860-1937) 1957年第七版后，由于越来越广泛地吸收了国际上细菌分类学家参加编写(如1974年第八版，撰稿人多达130多位，涉及15个国家；现行版本撰稿人多达300多人，涉及近20个国家)，所以它的近代版本反映了出版年代细菌分类学的最新成果，因而逐渐确立了在国际上对细菌进行全面分类的权威地位。 7.1 细菌分类系统 《伯杰氏系统细菌学手册》 (Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology) 伯杰氏手册是目前进行细菌分类、鉴定的最重要依据，其特点是描述非常详细，包括对细菌各个属种的特征及进行鉴定所需做的实验的具体方法。 （20世纪80年代末期） 7.2 真菌分类系统 真菌界分类系统很多，各国采用不同的系统，比较混乱。近年来为较多人接受的是Ainsworth的纲要。 * * * * * * * * * 俗名—common name简洁易懂，方便记忆，但涵义往往不够准确，还有适用范围和地区性的限制。 命名—scientific name菌种的科学名称。菌种的学名是按照《国际细菌命名法规》命名的国际学术界公认，并通用的名称。 命名原则： 学名=属名+种的加词+（首次定名人）+现名定名人和鲜明定名年份 规定与常识：属名应大写首字母、单数、可以组合外而成。种的加词代表一个种的次要特征，首字小写 利用16S rRNA建立分子进化树的美国科学家 Carl Woese 16S rRNA——分子计时器（molecular chronometers）或分子尺、或进化钟（evolutionary clock） 三域学说的建立 三域学说(three domains theory)及其 生物进化谱系树 三域: 细菌域(Bacteria) 古生菌域 (Archaea) 真核生物域 (Eukarya) 人类对微生物的认识水平是生物界级 分类的核心 微生物的进化地位： 通过放射性元素的计时技术，测得地球年龄约有45-46亿年。从最古老的微生物化石叠层岩中发现，类似细菌的生物在约35亿年前就已出现，此时地球开始由化学进化转入到生物进化阶段（此时为单极生态系，最早出现的生命形态主要是古生菌）； 发现蓝细菌类原核生物是在21亿年前,此时已进化到双极生态系统，并且地球大气开始由无氧变成有氧，并且开始有了阻挡紫外线的臭氧层，之后出现真核微生物； 大约6亿年前，水圈中出现了后生动物（摄食消费者），至此已形成了三极生态系；之后出现由“鱼—陆生生物—两栖类—爬行类”的进化趋势，人类诞生至今不过300万年。 三域学说(three domains theory)及其 生物进化谱系树 三域: 细菌域(Bacteria) 古生菌域 (Archaea) 真核生物域 (Eukarya) 人类对微生物的认识水平是生物界级 分类的核心 有人认为，如果把地球年龄比喻为一年的话，则微生物诞生的时间是在3月20日左右，人类出现的时间是12月31日下午7时左右，所以可以毫不夸张地说，微生物是一切生物（包括人类）的“老前辈”。 2、微生物分类学 经典分类学：按微生物表型特征分类 微生物系统学：按亲缘关系和进化规律分类 表型特征：形态学、生理生化学、生态学等，推断微生物的系统发育。 表型特征结合分子水平上的基因型特征（如16S rRNA)，探讨微生物进化地位、