第十一章核糖体教案.ppt

核糖体的结构 每个核糖体有供tRNA分子结合的3个位点：A位点，P位点，E位点 大小亚基结合面，mRNA和tRNA结合处无r蛋白分布 催化肽键的活性位点由RNA组成 r蛋白有一个分布于核糖体表面的球形结构域和伸入rRNA中的多肽链尾部 1）核糖体RNA 原核生物的核糖体含有三种大小不同的 rRNA，在小亚单位中的为 16s rRNA，在大亚单位中的为23S rRNA和 5S rRNA。 真核生物的核糖体含有4种rRNA，在小亚单位中的为18S rRNA，在大亚单位中的为 28S、5S和 5.8S rRNA。 rRNA具有高度复杂的二级结构，线性rRNA分子内部有70％的区段形成了双链螺旋。各种蛋白质则结合到折叠的rRNA分子上。 （2）核糖体蛋白 大肠杆菌核糖体中共含有50多种蛋白质，其中小亚单位约有21种，大亚单位含有30余种，组成核糖体的蛋白质，在大小亚单位中均有一定的空间分布。 真核生物的核糖体所含有蛋白质的种类比原核生物的要多一些，大亚单位含有49种，小亚单位含有33种，共计约80余种。 (二)、? 延伸 方向：mRNA 5/ 3/ 新生肽： N/ C/ （1）就位：第二个氨酰tRNA通过密码子—反密码子的配对作用进入核糖体的A位点（氨基位点）。 （2）转肽：在大亚基上肽酰转移酶（peptidyl transferase）的作用下，A位点氨基酸的A-氨基亲核攻击P位点氨基酸的羧基基团并形成肽键，结果两个氨基酸均连到了A位点的tRNA上，该过程称为转肽作用（transpeptidation），此时，P位点上卸载的tRNA从核糖体上离开。 （3）移位（translocation，也可称转位）：核糖体沿着mRNA移动1个密码子位置，携带肽链的tRNA转位到P位点，A位点空出以便接纳下一个氨基酸。 (三)、 终止 由于终止密码子不能结合任何氨酰tRNA，于是肽链合成的终止因子（又称释放因子）识别并结合到终止密码子上，接着肽转移酶的酯化酶功能转变成水解功能，将肽链从P位点tRNA上水解掉，核糖体释放掉mRNA并解体成大小亚基，翻译结束。 在翻译过程中除了核糖体大小亚基、 mRNA和氨酰tRNA外，还需要GTP和许多蛋白辅助因子。这些辅助因子有的起催化作用，有的起改变和稳定构象作用。 原核生物的蛋白质合成 原核生物（大肠杆菌）每秒钟可翻译20个氨基酸，比真核生物快得多，而真核生物每分钟才大约50个氨基酸。 (一)、? 翻译起始 翻译是从形成起始复合物开始的，在原核生物中该过程需要三个起始因子参与：IF1，IF2，和IF3。（IF1的功能尚不清楚）。 （1）IF3首先结合在30S亚基上，防止它过早地与50S亚基结合。 （2）mRNA结合到30S亚基上。 原核mRNA上在距起始密码子上游约10bp处有一段很短的（约10bp）富含嘌呤的区域称为SD序列，它能与30S亚基上的16S rRNA 3端的一段互补序列（不妨称反SD序列）配对结合，mRNA正是通过其SD序列与16S rRNA的配对结合而使它处于核糖体上的恰当的位置，并使起始密码子AUG处于P位点。SD序列与16S rRNA的配对还为识别起始密码子和Met密码子提供了一种机制。 （3）IF2 、fMet-tRNAfmet结合到30S亚基上 IF2是一个GTP结合蛋白，它先与30S亚基结合并促使起始氨酰tRNA的密码子与mRNA 上的AUG结合（P位点）。原核生物的起始氨酰tRNA是N—甲酰甲硫氨酰tRNA（fMet-tRNAfmet ）。 （4）50S大亚基结合到30S小亚基上，形成起始复合物。 GTP水解成GDP释放的能量引起30S亚基构象变化，50S亚基结合到30S亚基上，同时IF2和IF3释放。 因此，原核生物肽链合成的起始复合体由mRNA、70S核糖体、fMet-tRNAfMet组成。 (二)、????????????? 延伸 肽链延伸分三步进行：（1）新的氨酰tRNA进入核糖体的A位点；（2）肽键形成（转肽）；（3）核糖体移位（转位）。这三步构成了肽链延伸的一个循环。 1、 新氨酰tRNA入位 首先，在进入A位点之前，新氨酰tRNA必须与延伸因子EF—TU—GTP结合。延伸因子EF—TU是一个GTP结合蛋白，参与氨酰RNA的就位。氨酰RNA就位后，EF—TU—GTP水解，EF—TU—GDP从核糖体上释放下来，在第二个延伸因子EF—Ts帮助下EF—Tu—GDP释放掉GDP并重新结合一分子GTP再生成EF—Tu—GTP。 2、?????????? 肽键形成（转肽） 肽键是在肽酰转移酶催化下形成的，现在认为肽酰转移酶活性存在于50