2第二章蛋白质氨基酸案例.ppt

第二章 蛋白质化学 学习要求： 1、掌握蛋白质的基本概念及功能 2、了解氨基酸的结构、分类及理化性质 3、掌握蛋白质的1、2、3、4级结构及结构与功能的关系 4、掌握蛋白质的重要性质及应用 5、明确蛋白质的分类 目录 第一节 蛋白质元素组成、分类及生物学功能 蛋白质 一、蛋白质的元素组成 主要有C、H、O、N和S。 有些蛋白质含有少量P或金属元素Fe、Cu、Zn、Mn、Co、Mo、Se等，个别蛋白质还含有 I 。 (一) 按分子形状： 三、蛋白质的生物学功能 第二节 蛋白质的基本结构单位─ 氨基酸 一、氨基酸 ——蛋白质的基本组成单位 存在自然界中的氨基酸有300余种，但组成人体蛋白质的氨基酸仅有20种，且均属 L-?-氨基酸（甘氨酸除外）。 ?-氨基酸的通式 氨基酸 非蛋白质氨基酸在各组织和细胞中还存在150多种非蛋白质氨基酸，这些氨基酸是基本L型氨基酸的衍生物，也有一些是β-，γ-或δ-氨基酸，有的是D-型氨基酸。如： 蛋白质中几种重要的不常见氨基酸 蛋白质中的不常见的氨基酸，通常是由相应的基本氨基酸衍生而来的。 其中重要的有4-羟基脯氨酸、5-羟基赖氨酸、N-甲基赖氨酸、和3,5-二碘酪氨酸等。这些不常见蛋白质氨基酸的结构如下。 二十种常见蛋白质氨基酸的分类、结构及三字符号 非极性R基团氨基酸 不带电荷极性R基团氨基酸 带电荷R基团氨基酸 　 习惯分类方法 芳香族氨基酸：Trp、Tyr、Phe 含羟基氨基酸：Ser、Thr、Tyr 含硫氨基酸：Cys、Met 杂环族氨基酸：His 杂环族亚氨基酸：Pro 支链氨基酸：Val、Leu、Ile 　 几种特殊氨基酸 Gly：无手性碳原子。 Pro：为环状亚氨基酸。 Cys：可形成二硫键。 注意： ①背三字符号； （P12） ②带环的5种aa，三种带六圆环（苯、酪和色）两种带杂环（组和脯）。这些带环的aa在酶中扮演重要角色，特别是组氨酸的咪唑基。 芳香族氨基酸 杂环氨基酸 （氨基酸分类要求记忆的内容） ①非极性（中性）aa：丙、缬、亮、异、脯、苯、色、蛋（甲硫氨酸），8种。不易溶于水 ②极性不带电荷aa：甘、丝、苏、半、酪、天冬酰胺、谷氨酰胺，7种。易溶于水 ③极性酸性aa：谷、天冬2种。极易溶于水 ④极性碱性aa：赖、精、组，3种。极易溶于水 酸性氨基酸及酰胺 碱性氨基酸 三、氨基酸的性质 （一）氨基酸的旋光性 构成蛋白质的所有氨基酸都是L-氨基酸，因为构成蛋白质的所有氨基酸都具有旋光性。是对还是错？为什么？ TrpTyrPhe的 紫外吸收光谱 氨基酸的两性解离性质及等电点 下列哪种氨基酸在pH值为5时的溶液带正电荷？ A.PI为4.5的氨基酸 B.PI为7.4的氨基酸 C.PI为7.0的氨基酸 D.PI为6.0的氨基酸 (四)、氨基酸的化学性质 氨基酸与茚三酮反应 氨基酸与2,4一二硝基氟苯(DNFB)的反应（sanger反应） 氨基酸与苯异硫氰酯（PITC）的反应（Edman反应） 第三节 肽 肽键中的C-N键具有部分双键性质，不能自由旋转,使组成肽键的原子处于同一平面，称为肽平面。肽平面中的各原子组成的结构单位称为肽单元 多肽链有两端：N-端和C-端，习惯将N末端写在左侧。 肽单元组成多肽链的主链骨架，R基团是多肽链的侧链 肽和肽键的形成 谷胱甘肽 短杆菌肽S ?-天冬氨酰-苯丙氨酸甲酯 第四节 蛋白质的分子结构 蛋白质结构的主要层次 二、蛋白质的一级结构 一级结构测定 蛋白质顺序测 定基本战略 三、蛋白质的二级结构 　　蛋白质的二级结构（secondary structure）指它的多肽主链折叠的有规律重复的构象，它不涉及侧链上的原子在空间的排列。 酰胺平面与α-碳原子的二面角（ φ和ψ ） 维持蛋白质分子构象的作用力a.盐键 b.氢键 c.疏水键 d.范得华力 e.二硫键 （二）蛋白质二级结构的基本类型 1、α－螺旋（α－helix） 2、β－折叠（β-pleated sheet） 3、β－转角（β-turn） 无规则卷曲示意图 四、 蛋白质的超二级结构和结构域 超二级结构类型 卵溶菌酶的三级结构中的两个结构域 平行?-折叠的结构比较（a） ?-园桶形排布，（b）马蹄形排布 五、 蛋白质的三级结构 肌红蛋白三级结构 核糖核酸酶三级结构示意图 六、蛋白质的四级结构 六、蛋白质的四级结构 血红蛋白四级结构 第五节 蛋白质的分子结构与功能的关系 一级结构决定高级结构，也决定蛋白质的功能 高级构象决定蛋白质的功能 不同生物与人的Cytc