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蛋白样本制备与Western Blot 主要内容 一 蛋白样本制备成功蛋白分析的基础 二 蛋白样本制备的原则 二 蛋白样本制备的策略 三 案例分析-- 细胞中总蛋白的制备 细胞裂解液-RIPA Buffer的配方分析及技术要点 细胞裂解液-RIPA Buffer的配方分析及技术要点 细胞裂解液-RIPA Buffer的配方分析及技术要点 各类表面活性剂特点 选用表面活性剂考虑的因素 去除未结合的表面活性剂 细胞裂解液-RIPA Buffer的配方分析及技术要点 蛋白酶抑制剂及其鸡尾酒 细胞裂解液-RIPA Buffer的配方分析及技术要点 磷酸酶抑制剂选择 磷酸酶主要包括非特异性的磷酸酶(例如:碱性磷酸酶,酸性磷酸酶),特异性的丝氨酸/苏氨酸磷酸酶(例如:PP1, PP2A, PP2B) 、酪氨酸蛋白磷酸酶(例如:PTP)。 常规的抑制剂主要包括: 细胞裂解液-RIPA Buffer的配方分析及技术要点 细胞裂解液-RIPA Buffer的配方分析及技术要点 全蛋白抽提时注意事项 细胞裂解液-RIPA Buffer的配方分析及技术要点 四 蛋白样本制备产品选择指南 核蛋白样本制备 膜蛋白样本制备 膜蛋白的抽提 方法及原理 方法多 直接抽提法 分级抽提法 1:先机械法等非表面活性剂方法裂解细胞,再用表面活性剂抽提 2:按溶解性分级抽提 3:按亚细胞分级抽提 产物 细胞膜蛋白 细胞器质膜蛋白 注意事项 根椐膜蛋白种类和后续研究目的的不同,选择不同的产品或表面活性剂变性剂等. 抑制蛋白酶. 样本量 膜蛋白的直接提取 蛋白的分级提取 亚细胞分级抽提 四种亚细胞组分分离提取的结果 线粒体蛋白样本制备 其它蛋白抽提产品 高丰度蛋白去除试剂盒 信号蛋白提取试剂盒 糖蛋白提取试剂盒 细菌蛋白提取试剂盒 酵母蛋白提取试剂盒 植物蛋白提取试剂盒 五 蛋白定量产品选择指南 BCA法蛋白定量 Bradford法蛋白定量 Lowery法蛋白定量 六 成功的Western Blot 六 成功的Western Blot 蛋白变性 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳 SDS-聚丙烯酰胺凝胶最佳分离范围 聚丙烯酰胺分离胶配方 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳 SDS-聚丙烯酰胺凝胶浓缩胶配方 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳 SDS胶制备注意事项 过硫酸铵一般现配现用,如连续实验可在4度放置2-3天。配制30%丙烯酰胺储存液要过滤。 配制过程中每加入一种试剂要充分混匀,防止胶出现浓度不均的情况。 要根据温度调整TEMED的使用量。 水封的时候水要慢慢加入,太快会导致胶面不平。 插梳子的时候要用力均匀,一次成型。 在上样前可20V恒压预电泳20分钟,可去除泳道中的杂质。 上样及电泳 提前将样品沸水浴5分钟,12000-14000rpm离心5分钟。 根据自己的设计上样。 80V恒压跑浓缩胶。 看溴酚蓝压缩成一条线后把电压调为100V。 当溴酚蓝跑至离胶的下面还有0.4-0.6mm时停止电泳。 转膜 蛋白质带负电荷,凝胶在负极一侧,膜在正极一侧,接通电源以后,蛋白质由负极向正极转移至膜上。 转膜 转膜注意事项 PVDF膜要预先用甲醇活化;NC膜要预先泡水,除去中间的气泡。然后在转膜也中平衡20分钟。 膜、胶、滤纸夹好后要将中间的气泡全部赶出来,否则有气泡的地方就会断路,蛋白无法转到膜上。 转膜要在冰浴中进行,防止散热量太大导致转膜温度过高。 根据蛋白分子量大小选择适合的转膜条件。 膜的封闭 转好蛋白的膜 封闭 一抗孵育 二抗孵育 显影 显色方法 HRP酶促底物直接显色 显色方法—化学发光 成功的要素 质优量足的蛋白样本 科学的对照 正确的抗体选择 保存和使用 细致的实验操作 步步监测 科学的对照 蛋白Marker:预染或非预染各种分子量的蛋白,用于标示电泳中蛋白的大小和示踪 阳性对照:目的蛋白或明确表达目的蛋白的组织或细胞的蛋白提取物,用于检验整个实验体系和过程的正确性有效性/特别是一抗的质量和效率 阴性对照:非目的蛋白或明确不表达目的蛋白组织或细胞的蛋白提取物,用于检验抗体的特异性 二抗对照:不加一抗,用于检验二抗的特异性 内参对照:管家基因编码的、很多组织和细胞中都稳定表达的蛋白,用于检测整个WB实验过程及体系是否正常工作,并作为半定量检测目的蛋白表达量的标准对照 空白对照:不加一抗和二抗;用于检测膜的性质和封闭的效果 蛋白Marker WB常用内参及其技术参数 正确的抗体选择 保存和使用 实验细节 步步监测 蛋白样本 定量和SDS考马斯蓝染
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