产甲烷菌菌落特性及分子生物学技术分析.pptVIP

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2017-05-25 发布于湖北
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产甲烷菌菌落特性及分子生物学技术分析.ppt

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产甲烷菌的基因组特征产甲烷菌基因组大小一般介于1.6×106~5.7×106 bp之间甲烷杆菌目、甲烷球菌目和甲烷火菌目的基因组均为1.7×106 bp左右。甲烷八叠球菌目的基因组大小有较大差异，长度在3.4×106 bp、5.7×106 bp，也有的基因组大小仅为2.2×106 bp。甲烷微菌目和甲烷胞菌目的基因组大小在2.8×106~3.5×106 bp之间。产甲烷菌的基因组一般由一条环状染色体组成,也有一些产甲烷菌除了含一条染色体之外，还存在环状染色体外元件ECE，而且染色体和ECE 的GC 含量有较大差别产甲烷菌基因组的GC 含量在30%~65%之间，这与产甲烷菌所生存的环境有密切的关系，产甲烷菌生长所处的环境温度越高，一般GC 含量也越高。值得注意的是，甲烷球菌目的菌株GC 含量均较低，基本介于30%~35% 产甲烷菌的基因组特征目 Order 科 Family 种 Genus 基因组(bp) Genome (bp) G+C (%) 基因 Gene 阅读框 ORF 登录号 Number 甲烷杆菌目 Methanobacteriales 甲烷杆菌科 Methanobacteriaceae 热自养甲烷热杆菌 Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H 1 751 377 49.5 1 921 1 873 NC_000916 马堡甲烷热杆菌 Methanothermobacter marburgensis str. Marburg 1 639 135 48.6 1 806 1 757 NC_014408 甲烷球菌目 Methanococcales 甲烷球菌科 Methanococcaceae 詹氏甲烷球菌 Methanococcus jannaschii DSM2661 1 739 933 31.3 1 823 1 771 NC_000909 海沼甲烷球菌 Methanococcus maripaludis C5 1 780 761 33 1 889 1 822 NC_009135 海沼甲烷球菌 Methanococcus maripaludis C6 1 744 193 33.4 1 888 1 826 NC_009975 海沼甲烷球菌 Methanococcus maripaludis C7 1 772 694 33.3 1 855 1 788 NC_009637 海沼甲烷球菌 Methanococcus maripaludis S2 1 661 137 33.1 1 772 1 722 NC_005791 海沼甲烷球菌 Methanococcus maripaludis X1 1 746 697 32.9 1 890 1 848 NC_015847 甲烷火菌目 Methanopyrales 甲烷火菌科 Methanopyraceae 坎氏甲烷火菌 Methanopyrus kandleri AV19 1 694 969 61.2 1 729 1 687 NC_003551 甲烷八叠球菌目 Methanosarcinales 甲烷八叠球菌科 Methanosarcinaceae 噬乙酸甲烷八叠球菌 Methanosarcina acetivorans C2A 5 751 492 42.7 4 721 4 540 NC_003552 马泽氏甲烷八叠球菌 Methanosarcina mazei Go1 4 096 345 41.5 3 434 3 368 NC_003901 马泽氏甲烷八叠球菌 Methanosarcina mazei Tuc01 3 427 949 42.5 3 444 3 252 NC_020389 调查甲烷盐菌 Methanohalobium evestigatum Z-7303 2 242 317 36.4 2 437 2 254 NC_014253 甲烷鬃毛状菌科 Methanosaetaceae 理事会甲烷鬃毛状菌 Methanosaeta concilii GP6 3 026 645 51 2 927 2 850 NC_015416 甲烷微菌目 Methanomicrobiales 甲烷微菌科 Methanomicrobiaceae 居泥甲烷盘菌 Methanoplanus limicola DSM 2279 3 200 946 42.2 3 129 2 942 NZ_CM001436 甲烷规则菌科 Methanoregulaceae 甲酸甲烷规则菌 Methanoregula formicicum SMSP 2 828 858 55.2 2 924 2 816 NC_019943 甲烷螺菌科 Methanospir