4个猪繁殖性状候选基因对大白猪产活仔数的影响精编.doc

4个猪繁殖性状候选基因对大白猪产活仔数的影响刘 远1，李良良1，王振华2，李文献2，王建华1，熊远著1，雷明刚1*( （1．华中农业大学动物科技学院，湖北武汉 430070 ；2．湖北天种畜牧股份有限公司，湖北武汉 430344） 摘 要：为了研究猪繁殖性状候选主效基因的遗传效应，并应用于猪繁殖性状改良，试验选择472头大白能繁母猪作为基础群，检测4个控制猪繁殖性状的候选主效基因ESR、FSHβ、PRLR和RBP4的4个基因在该群体的多态性分布以及其对产活仔数的影响。结果表明：除了RBP4基因为AA纯合子外，ESR、FSHβ、PRLR 3个基因上均存在不同程度的多态性，并且B等位基因的频率要高于A等位基因，分别为0.507、0.553、0.718。ESR基因不同基因型对产活仔数没有显著影响；FSHβ不同基因型的经产胎次和全部胎次中产活仔数的效应为ABAABB，其中AB基因型群体产活仔数显著的高于BB基因型；PRLR基因上的基因型差异对产活仔数的影响是最大的，其中AA基因型群体的产活仔数要显著高于其他两种基因型。 关键词：产仔数；ESR；FSHβ；PRLR；RBP4；猪 中图分类号：S828.2 文献标识码：A 文章编号：0258-7033（2011）03-0000-00 随着分子生物学和生物信息学的发展，猪繁殖性状形成的分子机理逐步被人们认识，大量分布于整个猪基因组的控制繁殖性状候选基因分离。利用这些信息可以对猪繁殖性状进行标记辅助选择，缩短该性状的育种周期，提高选择准确性，获得一定的经济效益。ESRFSHβ、PRLR、RBP4然而，繁殖性状的形成过程是受多个基因同时控制的，通过一个或少数几个基因或标记的信息取得较大的遗传进展也是很困难的[5]。通过基因聚合的方法将这些基因聚合在同一个品种中，从而形成一个超级品种，[6]。获得符合试验要求的大群体比较困难以及近交衰退等因素的制约，广泛开展基因聚合育种存在一定的难度[7]。借助猪基因组信息动物基因聚合的理论分析，通过基因聚合对动物低遗传力性状进行改良仍将是有效的[7]。鉴于此，以基因聚合理论为指导，在检测目标群体主效基因ESR、FSHβ、PRLR和RBP4多态性基础上，研究不同基因型与产仔数等繁殖性状的关联，进行猪基因聚合育种的可行性分析。1材料与方法 1.1试验样品 472头经产大白母猪的血液样品采自湖北天种畜牧股份有限公司，该群体按四阶段后备种猪选择原理进行选择。用常规的酚氯仿抽提法提取猪基因组DNA，纯化后进行目的基因基因PCR-RFLP分型。统计采样母度有效产活仔数1 774胎，其中初产胎次306胎。 1.2 PCR扩增及酶切分型 4个基因PCR方法、条件等参考文献[8]进行，PCR-RFLP分型相关资料见表1。 表1 4个基因PCR-RFLP分型相关资料 基因 PCR扩增引物（5’→3’） PCR产物大小/bp 内切酶 不同基因型酶切片段/bp AA AB BB ESR F:CCTGTTTTTACAGTGACTTTTACAGAG R:CACTTCGAGGGTCAGTCCAATTAG 120 PvuⅡ 120 12065/55 65/55 FSH F:ACTGGTCTATTCATCCTCTC R:CCTTTAAGACAGTCAATGGC 500或220 500 500/220 220 PRLR F:CGTGGCTCCGTTTGAAGAACC R:CTGAAAGGAGTGCATAAAGCC 163 AluⅠ 85/59/19 104/85/59/19 104/59 RBP4 F:GAGCAAGATGGAATGGGTT R:CTCGGTGTCTGTAAAGGTG 480 MspⅠ 190/154/136 190/154/136/125/65 154/136/125/65 （请交代清楚PRLR、RBP4酶切基因处于PCR产物内的具体位置，确认产物片段大小是否正确） 1.3统计分析 4个基因酶切分型后分别计算基因型频率与基因频率并对各个基因基因型分布进行哈代-温伯格平衡的2检验。运用SAS 8.2软件的GLM过程分别统计分析4个（本试验中以“位点”还是“基因”表示更为准确？核对全文）不同基因型与产活仔数的关系，针对该猪场每个季节以及每个年份的流行病不同特点，分别将产仔季节以及产仔年份作为单独的因素考虑，以消除部分随机误差，提高分析的准确性；REG过程用来进行各基因产活仔数的效应分析。 利用GLM过程分析中用到如下模型： Y1 =平均数+基因型效应+母猪产仔季节+母猪产仔年份+残差 Y2=平均数+基因型效应+母猪产仔季节+母猪产仔年份+胎次效应+残差 Y3=平均数+合并基因型效应+母猪产仔季节+母猪产仔年份+残差 Y=平