第 三章_核_酸( 三).pptVIP

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第 三章_核_酸( 三)

* * 第三章 核 酸( 三) 生物分子之二 六、核酸碱基顺序的测定 * 六 、核酸碱基顺序的测定 1、DNA碱基顺序测定方法 基本步骤: A、DNA片段的制备 利用限制性内切酶技术选择性地在某些特定位点将DNA链切断,产生能够用于测定的较小片段。 B、DNA片段的碱基顺序测定 Maxam-Gilbert法(化学降解法) Sanger法(末端终止法) 获得DNA小片段的方法 * 1)Maxam-Gilbert(化学降解法) 原理:选择性地切断某种特定核苷酸所形成磷酸二酯键,得到不同链长的DNA小片段, 然后进行电泳分析和碱基顺序推测。 DNA小片段制备(单链DNA) * 注意: 1)选择性水解后,水解位点上的含氮碱基都消失了; 2)水解反应都是不完全的,得到的是不同长度的DNA片段混合物 * * * 硫酸二甲酯(G): *ACTTCG *ACTTCGACAG 甲酸(A): *A *ACTTCG *ACTTCGA *ACTTCGACA *ACTTCGACAG 肼/NaCl(C): *AC *ACTTC *ACTTCGA C *ACTTCGACAG 肼(T): *AC *ACT *ACT T *ACTTC *ACTTCGAC *ACTTCGACAG 32P *ACTTCGACAG 待测样品需分为四份 * 将这个DNA单链片段的5’端进行标记 ↓ 用4种特异性化学试剂进行不同步断裂 ↓ 电泳分离各产物 ↓ 放射自显影 ↓ 直读DNA序列 总结化学降解法 端位碱基不能直接读出,需要特殊端基分析方法确定,例如控制合成互补链的方法! * 2)Sanger法(末端终止法) 英国 Sanger 1955 确定牛胰岛素结构, 1958 获诺贝尔化学奖1975 设计出DNA测序法, 1980 获诺贝尔化学奖 合成一段与待测DNA序列互补的DNA片段群 * dNTP: dATP, dGTP, dCTP,dTTP * * DNA互补链的合成 引物 * DNA互补链的合成 * dNTP作放射性标记 * 3)DNA序列分析仪: 四色荧光基团标记的dNTP 以荧光标记物代替同位素标记 * 2、RNA碱基顺序测定方法 在DNA测序方法基础上发展的RNA测序法 主要 待测RNA链 与RNA互补的DNA DNA碱基顺序 RNA的碱基顺序 逆转录酶 Sanger (模板)

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