结核分枝杆菌38kDa蛋白结构与功能的生物信息学分析.docVIP

结核分枝杆菌38kDa蛋白结构与功能的生物信息学分析 　　摘要：目的 应用生物信息学分析软件预测结核分枝杆菌38kDa蛋白氨基酸序列的结构与功能。方法 应用NCBI、Expasy等在线生物信息学网站及DNAstar、Rasmol等软件包分析38kDa蛋白与其他物种的同源序列，进行多序列同源比对；预测二级结构、三级结构；预测主要抗原表位等。结果 同源性比对结果表明结核分枝杆菌38kDa蛋白结核分枝杆菌磷酸盐转运蛋白同源性达87%；预测该蛋白的分子质量单位为39113.47 Da，理论等电点为11.779；该蛋白跨膜区有2个，分别为7-23，7-105，其结构域5个分别位于8-22、35-47、48-79、214-232、233-286。结论 生物信息学技术在结核分支杆菌38kDa蛋白研究中有一定的理论和应用价值。 　　关键词：结核分枝杆菌；38kDa；生物信息学；结构；功能 　　Bioinformatics Analysis for the Structure and Fuction of 38kDa Protein of Mycobacterium Tuberculosis 　　ZHANG Yi-qing1，YANG Yuan-yuan2，DING Shu-qin1 　　（1.Ningxia Medical University，Yinchuan 750004，Ningxia，China；2.The First Peoples Hospital of Yinchuan，Yinchuan 750001，Ningxia，China） 　　Abstract：Objective To predict the structure and function of recombinant 38kDa of Mycobacterium tuberculosis using bioinformatics method . Methods By online analysis at bioinformatics websites such as NCBI and Expasy ，employing software packages such as DNAstar and Rasmolto do multi-sequence homological alignment， secondary structure and tertiary structure，antigenic epitope analysis，etc. Results Similarity of 38kDa of Mycobacterium tuberculos compared to phosphate-binding protein of Mycobacterium tuberculosis was 87% . Analysis of the predicted protein indicated a molecular mass of 39113.47 Da， PI was 11.779 ， two transmembrane region， function sites and eight antigen epitope were found . Conclusion Bioinformatic is valuable to the study 38kDa 6 ofMycobacterium tuberculosis. 　　Key words：Mycobacterium tuberculosis ； 38kDa ； Bioinformatics；Structure and fuction 　　结核病是全球卫生问题之一。2012年WHO的数据显示，全世界约有860万人罹患结核病，130万人死于结核病[1]。中国是全球22个结核病高负担国家之一，卫计委已将结核病列为全国重点控制重大疾病之一。及时有效的诊断对结核病的防治具有重要的意义。结核分枝杆菌诊断抗原的筛选是目前研究的热点。 　　38kDa 蛋白又名pab，是一种磷酸盐转运蛋白，是MTB分泌较多的抗原。研究表明其属于分泌蛋白，结核病患者体内抗38kDa 蛋白抗体水平较高[2]。38KDa 蛋白广泛用于结核病的血清学诊断试验，检测的敏感性和特异性均较高。有关报道38kDa 的诊断特异度在88%～100%之间，痰涂片阳性患者诊断灵敏度36%～89%，痰涂片阴性患者灵敏度16%～54%、肺外结核诊断灵敏度12%～56%[3]。Wu X[4]的研究成果表明：38KDa 蛋白诊断结核病的敏感性为73.6%，特异性为85.4%，并且发现PPD 阳性血清中的抗38KDa 抗体水平高于PPD 阴性。国内张萍等[5]