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設備參考技術參數(生物信息學實驗室).-第三軍醫大學電子郵件系統.doc
第一包:参考数据库及样本管理设备
项目名称 数量 参数 1 一、数据类型:
文献已经报道的与人类遗传疾病相关的遗传突变数据,包括近3年数据
二、技术参数:
突变数据量190000条
基因数量7000
HGVS170000个
mRNA剪切突变17000个
三、资质要求:
1、投标人需从事高通量测序相关业务,需自主拥有二代测序平台并提供平台证明材料;
2、具有多组学平台和联合分析能力;
3、具有ISO9001质量管理体系认证证书;
4、具有优良项目工作环境,如风淋系统;
投标人的服务对象在影响因子期刊上以第一作者(或通讯作者)发表并提供支撑材料。 1 一、数据类型:
恶性肿瘤病人组织和体液样本的组学数据以及病人临床预后等表型信息。
二、技术参数:
宏转录组数据要求:
每个样品分别建库测序,采用宏转录组的建库方式;
样品每个产生不低于 10G 的clean data;
Q2090,Q30≥80%;
碱基类型分布均匀且无分离现象;
信息分析要求:原始数据统计,序列拼接组装,基因预测,物种分类学注释,功能注释等;
项目完成周期不超过60个工作日。
宏蛋白组数据要求:
鉴定的蛋白质数目需在500-1000之间,通常情况下,差异蛋白质数目占总蛋白质数目的5%-15%,谱图3W-20W,谱图利用率20%-50%;
信息分析要求:蛋白质表达差异分析、差异蛋白功能注释;
项目完成周期不超过40个工作日。
宏代谢组数据要求:
数据来源:非靶向代谢组学,LC-MS法测定;
分析要求:多元统计分析(.
三、资质要求:
1、投标人需从事高通量测序相关业务,需自主拥有二代测序平台并提供平台证明材料;
2、具有多组学平台和联合分析能力;
3、具有ISO9001质量管理体系认证证书;
4、具有优良项目工作环境,如风淋系统
5、近5年投标人的服务对象在影响因子期刊上以第一作者(或通讯作者)发表并提供支撑材料。 1 一、数据类型:
人类复杂疾病相关的人体样本如粪便,血液,皮肤和唾液等微生物组的组学数据。
二、技术参数:
1、每个样品分别建库测序,采用宏转录组的建库方式;
2、唾液样品每个产生不低于的clean data;
3、Q2090,Q30≥80%;
4、碱基类型分布均匀且无分离现象;
5、信息分析要求:原始数据统计,序列拼接组装,基因预测,物种分类学注释,功能注释等;
6、项目完成周期不超过60个工作日。
三、配置参数:
1、投标人需从事高通量测序相关业务,需自主拥有二代测序平台并提供平台证明材料;
2、具有多组学平台和联合分析能力;
3、具有ISO9001质量管理体系认证证书;
4、具有优良项目工作环境,如风淋系统;
投标人的服务对象在影响因子期刊上以第一作者(或通讯作者)发表并提供支撑材料。 1 一、技术参数:
小分子化合物数量2000万个以上;
包含3000种以上具有生物活性的化合物;
可用于高通量筛选(HTS)和高内涵筛选(HCS);
包含的子化合物库大于20个,可用于GPCR、激酶、抗癌、表观遗传学、干细胞等研究领域;
靶点要求涵盖PI3K、NMDA、Influenza Virus、EGFR、CXCR等;
能够提供独有的临床阶段化合物库和最新的在研临床小分子化合物
存储 1 一、技术参数:
压缩机功率(W):1HP×2?
箱内温度(℃):-10~-86?
外部尺寸(W×D×H)(mm):1000×890×1960?
内部尺寸(W×D×H)(mm):760×630×1300?
有效容积(L):626,立式?
搁架/内门(板):3/2
单位存储数量:20
二、配置参数:
包含 20个五层四列,130*130*52mm的生物样本存储归类装置
参数
数量 配置和参数 管理节点 1 国产品牌;
2U机架式服务器,配置安装导轨
配置2 颗 Intel Xeon Processor E5-2609V4 8C/8T 1.7GHz 20M 6.4GT/s 85W;
配置2 根16GB/DDR4/2133/MHz/ECC/REG/2RANK ;不少于24DIMM内存插槽,支持 DDR4的
配置3块600GB/SAS/10000RPM/2.5寸/企业级8个3.5”/2.5” SATA/SAS/SSD硬盘,可内置两个2.5” SATA/SAS/SSD硬盘,最大支持存储容量52TB。支持SATA RAID0、1、10、5,
配置一张LR282A2/8口/SAS 6GB/512MB/半高/SFF8087/PCLE 2.0*8
1 张 Mellanox/56GB/40GB/单口IB卡/主要用于56GB交换网络/HCA卡
1 张 16Gb/PCI-E双口/光纤HBA卡
配置指纹安全加密认证系统;
DVD/R
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