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电泳技术及其在分子生物学中的应用 环境科学与技术研究中心 电泳是带电荷的胶体颗粒在电场中的移动。 净电荷：生物大分子如蛋白质、核酸、多糖等常以颗粒形式分散在溶液中，它们的净电荷取决于介质的H+浓度与其他大分子的相互作用。 在电场中，带电颗粒向阴极或阳极迁移，迁移的方向取决于它们带电的符号。 电泳的实现还依赖于支持介质的存在。 电泳的三要素 以淀粉胶、琼脂或琼脂糖凝胶、聚丙烯酰胺凝胶等作为支持介质的区带电泳法称为凝胶电泳。 琼脂糖凝胶电泳 （agrose gel electrophoresis ） 聚丙烯酰胺凝胶电泳 （polyacrylamide gel electrophoresis，PAGE） 凝胶电泳 用于分离、鉴定和纯化DNA片段 重点内容 影响DNA在琼脂糖凝胶中的迁移速率的因素有哪些？ Western blotting 的基本实验步骤,及每一步的操作意义. 琼脂糖凝胶电泳 琼脂糖（agarose）是由琼脂分离制备的链状多糖。其结构单元是D-半乳糖和3.6-脱水-L-半乳糖。许多琼脂糖链依氢键及其它力的作用使其互相盘绕形成绳状琼脂糖束，构成直径从50nm到略大于200nm的三维筛孔的通道。 ???????? 凝胶的制备 ????以琼脂糖为溶质，电泳缓冲液为溶剂，用微波炉加热，配制一定浓度的溶胶，灌入水平胶框，插入梳子，自然冷却。 缓冲液系统 ??? 常用的电泳缓冲液有EDTA（pH8.0）和Tris-乙酸（TAE），Tris-硼酸（TBE）或Tris-磷酸（TPE）等，浓度约为50mmol/L(pH7.5~7.8)。 含不同量琼脂糖的凝胶的分离范围 凝胶中的琼脂糖含量 [%（w/v）] 线状DNA分子的有效分离范围（kb） 0.3 5-60 0.6 1-20 0.7 0.8-10 0.9 0.5-7 1.2 0.4-6 1.5 0.2-3 2.0 0.1-2 琼脂糖浓度的选择：根据被分离线状DNA片断的大小 样品配制与加样 ????DNA样品用适量Tris-EDTA缓冲液溶解，缓冲液内含有 0.25%溴酚蓝或其他指示染料， 含有10%-15%蔗糖或5%~ 10%甘油，以增加其比重，使样品集中。 电泳 ?? 低电压下，分离效果较好。在低电压条件下，线性DNA分子的电泳迁移率与所用的电压呈正比。 因此，为了获得电泳分离DNA片段的最大分辨率，所用电压不宜高于5V/cm。 cm ：电场正负极间的距离。???? 染色和拍照 ???? 常用荧光染料溴化乙锭（EB）染色，在紫外光下观察DNA条带，用紫外分析仪拍照，或用凝胶成像系统输出照片，并进行有关的数据分析。 琼脂糖凝胶中DNA的染色 荧光染料溴化乙锭（EB） 含有一个可以嵌入DNA或RNA的堆砌碱基之间的一个平面基团 与核酸结合后在紫外线激发下呈现橘黄色荧光，荧光的位置代表核酸片段所在的位置，荧光的强弱代表核酸量的多少,可以检测到少至10ng的DNA条带。 可用于检测单链或双链核酸（DNA和RNA）。 将已知分子量的标准DNA的迁移率对分子量对数作图，可获得一条标准曲线，未知DNA片段在相同条件下进行电泳，根据它的电泳迁移率即可在标准曲线上求得其分子量。 双链DNA分子在凝胶基质迁移的速率与碱基对数目的常用对数成反比。 双链DNA分子在凝胶中的迁移率 影响DNA 在琼脂糖凝胶中的迁移速率的因素 DNA分子的大小 琼脂糖浓度 ； DNA的构象 ：超螺旋环状（I型）、切口环状（II型）和线状（III型）；共价闭环DNA＞直线DNA＞开环双链DNA。当凝胶浓度太高时，凝胶孔径变小，环状DNA（球形）不能进入胶中，相对迁移率为0，而同等大小的直线DNA（刚性棒状）可以按长轴方向前移，相对迁移率大于0。 凝胶和电泳缓冲液中的溴化乙锭; 所用的电压 ：低电压时，DNA片段迁移率与所用的电压成正比；电场强度升高时，高分子质量片段的迁移率遂不成比例的增加； 电泳缓冲液 ：组成和离子强度 。 聚丙烯酰胺凝胶 聚丙烯酰胺凝胶电泳（polyacrylamide gel electrophoresis，PAGE） 聚丙烯酰胺凝胶是由丙烯酰胺单体，在催化剂TEMED(N，N，N，N一四甲基乙二胺)和 过硫酸铵的作用下，丙烯酰胺聚合形成长链，聚丙烯酰胺链在交联剂，N，N一亚甲双丙烯酰胺参与下，聚丙烯胺链与链之间交叉联接而形成凝胶. 与琼脂糖凝胶电泳的比较, PAGE的特点 分辨率很强，长度上相差1bp的DNA即可分开； 从聚丙烯酰胺凝胶中回收的DNA纯度很高，可适用于要求最高的实验（如胚胎注射）； 装载更