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细胞与分子生物学考题 Chapter 3 Protein Structure Function 1. The primary, secondary, tertiary and quaternary structures of proteins. N972010028 黄琴淑 (1) 一级结构 (primary structure) :蛋白质的序列称之为蛋白质的「一级结构」。 (2) 二级结构 (secondary structure) : 一级结构上的胺基酸间可交互作用，利用醯胺键上的C=O键与胺基形成氢键。这样形成的简单又有规则的结构，称之为二级结构 (secondary structure)。蛋白质有α螺旋 (helix)与 beta 折曲平面 (pleated sheet); 两种主要而且规则的二级结构，由这些简单的结构又可组合成一些独立折叠的单元，称之为模组（motif）。 (3) 三级结构 (tertiary structure) :蛋白质的三级结构是由一条多月生(polypeptide)链组成，可包含一个或多个模组。 (4) 四级结构 (quaternary structure)：蛋白质的三级结构是由一条多月生(polypeptide)链组成，可包含一个或多个模组。一个含有多个次单元蛋白质中，每个次单元都是一个三级结构，次单元间可能有疏水性作用，盐桥等交互作用而形成四级结构，所以含有多个次单元的蛋白质才有四级结构 (quaternary structure)。 第壹题参考资料 蛋白质的一级结构 将蛋白质中胺基酸顺序视为整体构造，是一种用有机化学词语来描述分子的完全方法。自很多不同蛋白质的顺序分析中可以看出，每种蛋白质都有其独特的结构，而顺序排列即是该种系的特性。在少数的情形中，特殊的器官或组织也具有特定结构的蛋白质，更进一步的，蛋白质可以如细胞分裂一般很正确地被复制出相同顺序的蛋白质。我们可以参考牛的胰岛素(Bovine insulin)；更正确地说，是参考proinsulin。Proinsulin为生物活性贺尔蒙的先质(precursor)，藉着正常牛的胰脏岛状细胞仔，细地做成的一种特定构造。牛的胰岛素和其他哺乳类的胰岛素几乎是相同的，通常只有一个胺基酸不同，即A链中第8，9或10位置胺基酸的改变。这些相似性使得这方面的研究迅速扩展，虽然在不同种类中，胺基酸会发生变化，但在18位置的胺基酸很明显地绝不会改变。研究不同种系中蛋白质的顺序，是现在研究构造与功能间关系的一种方法。 ? 蛋白质的一级构造提供了我们分子有机-化学的性质描述，但却不能描述蛋白质中聚肽链的构造，必须使用其他实验方法后才能得到蛋白质分子的真正构造。 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ·??????? 参考资料: 王立禾, 阮立昂译 蛋白质构造与功能 P4~6 复汉出版社 (1977) ? 蛋白质的二级结构 ? ? 一、肽鍵的平面性質(Planar nature of the peptide bond) 二、α-螺旋狀體(α-helix) 三、β-結構(β-structure) 四、纖維狀與球狀蛋白(Fibrous and globular proteins) ? 一、肽键的平面性质(Planar nature of the peptide bond) ? 用物理方法测定不同种类的蛋白质，显示球状蛋白质(globular protein)不适合用直线延展的聚肽链表示，而要用紧而高度摺叠的结构表示。因此蛋白质分子的完整描述，必须包括聚肽链之形态，以及支链上取代基的位置、键结的详细分析。蛋白质的二级构造，正是和聚肽链的三度空间排列有关的构造。 ? Pauling与Corey用x-光绕射(x-ray diffraction)研究个别的胺基酸，以及许多dipeptide与tripeptide，以此建立peptide的结构单位。α-碳原子的键角及键长是和标准的正四面体的碳相同，然而在peptide bond中C-N键的长度则在单键及双键长之间；peptide bond的部分双键性质有助于Pauling及Corey了解peptide bond的面性质。在peptide bond上的四个取代基(substituents)几乎全部都是反式配置(trans-configuration)，因此在carbonyl group上的氧与在氮上的氢，位置是成对角线的。 ? 在有两个或更多的胺基酸参与聚肽链结合时，peptide bond的平面性质受到排列及方向的限制；既然α-碳是作为两个胜肽平面间的转轴点(Swivel point)，故可利用C-N键角的旋转-角Φ，和C-C见角的旋转-角ψ来描述其排列方向。一般而言为了减低空间阻碍(s