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第三章基因表达的调控基因表达DNA→mRNA→蛋白质的遗传信息.doc
第三章 基因表达的调控
基因表达:DNA→mRNA→蛋白质的遗传信息传递过程
基因表达的调控
基因的活化
基因的“开关”-染色质的活化
一、活性染色质的结构
间期核染色质:
异染色质(heterochromatin),高度压缩(不转录);
常染色质(euchromatin),较为松散,
常染色质中约10%为活性染色质(更开放疏松)。
活性染色质→←非活性染色质
二、活性染色质的结构特点
(一)DNaseI敏感性
转录活性(或有潜在转录活性)的染色质对DNase I更敏感.
DNase I超敏感位点(DNase I HyperSensitive Sites,DHSS)
(二)组蛋白H3的CyS110上巯基暴露,
三、活性染色质结构的形成
(一)、核小体位相(Phased positioning)
1.核小体的旋转定位(rotational positioning)
指核小体核心与DNA双螺旋在空间结构中的相互关系,主要包括DNA双螺旋的大沟是面向还是背向核心结构. ‘
2.核小体的平移定位(translational positioning)
指核小体与特定DNA序列的结合位置和方式,特别是转录活性相关的DNA调控元件(启动子、增强子等)序列与核小体的相互位置关系。
(二)、组蛋白修饰
1.H1组蛋白磷酸化
促进染色体包装,影响转录活性,
2.核心组蛋白修饰
乙酰化:常发生在组蛋白的Lys,
一般活性染色质是高度乙酰化的。
(三)HMG蛋白结合
HMG(high mobility group)蛋白—高迁移率蛋白, 如HMG14/HMG17.
与核小体核心颗粒结合,有利转录。
四、DNA甲基化与基因表达 .
(一)、真核生物基因组DNA的甲基化(Methylation)
哺乳动物基因组中5%的C为甲基化(m C),mC主要存在于CpG二核苷酸中.
CpG二核苷酸序列常成簇聚集并零散地分布于人基因组中,形成CpG岛(CpG islands).人基因组中约每10Kb就有一个CpG岛.
CpG岛常与基因相连(可作为寻找基因的标记)。
(二)DNA甲基化的转录抑制作用。
基因表达与甲基化呈负相关
基因甲基化状态:
1、高度甲基化: 基因为持续失活(如女性的一条X染色体;
2、诱导去甲基化:如组织或发育阶段特异性表达基因;
3、持续低水平甲基化:具有转录活性(如持家基因)。
持家基因(housekeeping gene): 是指对所有类型组织细胞在任何时候都需要其表达的基因,通常都是维持细胞基本生存所必须的基因,其表达常保持在固定的水平。又称为组成性基因(Constitutive gene)。
(三)甲基化与基因组印迹
基因组印迹(genomic imprinting):指基因表达活性只局限于来自双亲之一的基因版本。
被印迹(imprinted)的基因.
基因组印迹的机制--DNA高度甲基化
基因组印记与肿瘤.
第二节 转录水平的调控
转录水平的调控是基因表达调控中最重要的环节。
一、真核基因转录基本条件:
特异性基因转录的基本条件包括:
①启动子(特别是核心启动子)
②转录模板(转录起始点(+1)---终止点)
③RNA PolⅡ
④普通转录因子(GTFs)
(一)启动子(promoter)
与基因转录启动有关的一组DNA序列,一般位于RNA poII转录起始点上游100-200bp以内,其功能是决定转录的起始点和调控转录频率.
启动子区域包括核心启动子和启动子上游近侧序列:
1、核心启动子(core promoter)
是决定转录起始位置的关键序列,也是普通转录因子TFⅡD的结合位点,
①TATA盒(TATA box) 位于转录起始点上游-25~-30bp.
②起始子(initiator,Inr) Inr是与转录起始位点重叠的短的较保守序列.
注:①不是所有基因都含有TATA盒或Inr序列.有的只有其中之一,有的两者都无.
②这些核心启动子的序列和它们之间的间隔多变
2、上游启动子元件(Upstream Promoter element,UPE)
位于较上游(-30一-110bp),能较强影响转录起始的频率,如CAAT 盒和GC盒.其中GC盒是转录因子SPl的结合位点。
(二)RNA聚合酶Ⅱ
负责真核生物蛋白编码基因的转录(产物mRNA),有7-10个亚基,最大亚基的羧基末端结构域(CTD)具有7个氨基酸(Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser -Pro-Set)的重复序列,其中有多个磷酸化位点
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