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論 文 寫 作 與 報 告 期 中 作 業 將DNA染色可以降低定序成本 日 期：94年4月28日 一、 目的： 這是一種新的技術將DNA各核甘酸染成不同的顏色色，用鐳射定序的彩色編碼DNA，可以提供基因序列定序的方法，與傳統方法相比較會更快和更便宜的方式。 二、原理： 利用ATGC 配對，複製基因一模一樣  一九五三年，英國劍橋大學年輕科學家華生和克立克（J.D. Watson 和 F. Crick）發現，生命的遺傳資訊儲存在 DNA 結構中。這些遺傳資訊，可用 ATGC 四個密碼代表。DNA 是兩條非常長，由 ATGC 四個密碼結合而成的化學分子，這兩條 DNA 分子互相纏繞，形成雙螺旋結構。 仔細觀察雙螺旋間 ATGC 的對應，可以看出一個非常重要的配對關係，那就是 AT 與 GC 之間的準確配對。只要看到其中一條 DNA 分子上的密碼排列，即使沒有見到另一條，也可以馬上知道它的密碼排列是些什麼。A 的對面一定是 T；G 的對面一定是 C。AT、GC 的配對關係，決定了儲存在雙螺旋 DNA 分子中的遺傳程式的資訊內涵。  細胞分裂時，會有適當機制確保在 DNA 複製過程中遺傳資訊不會發生任何錯誤！由於 DNA 的兩條分子是利用 AT、GC 的配對關係來決定資訊內涵，當複製時，雙股 DNA 會打開，其中一股當作模版，製造出一新一舊的雙股 DNA，新的 DNA 分子中所蘊含的遺傳資訊和原來的一模一樣，不會出錯。 但再好的硬體也有出錯的可能，當 DNA 複製時發生錯誤，就形成了所謂的「突變」。生物體在演化過程中，就是因為各種基因突變而產生各式各樣的基因改造，並衍生出今日的各種生命形式。  如果將基因遺傳程式當作一個相對於電腦的程式，一旦細胞受到不同的外界刺激，它就從三萬到四萬個遺傳程式中擷取必要的程式，指導細胞進行反應。人類的遺傳程式是由三十億個遺傳密碼所寫出，當人類基因組計畫完成後，這三十億個遺傳密碼的排列順序就完全決定，並公諸於世。除紅血球沒有細胞核，無法儲存遺傳資訊外，所有人類細胞中的遺傳密碼，都儲存在人類的 23 對染色體裡。  三、DNA染色方法： 透過DNA染色中，將ATGC四個核甘酸染成不同的顏色， Jingyue Ju是一位化學工程師，他和在美國紐約市的哥倫比亞大學同事用這樣的方法已經定序出一個人類的基因體的小部分。更多的工作後，這種技術能夠用在數百萬更長的平行DNA 股的定序，這會大量降低整個哺乳動物的基因定序的費用。 在一般的DNA中要染色的部分，被稱為「核甘酸」，組成 DNA 的生物分子是去氧核醣核酸（deoxyribonucleic acid, DNA）是負責遺傳的主要分子，由Ａ（adenine，腺嘌呤）、Ｔ（thymine，胸腺嘧啶）、Ｃ（cytosine，胞嘧啶）、Ｇ（guanine，鳥糞嘌呤）四個基本鹼基單位、五碳醣及磷酸根所組成。一條 DNA 上的鹼基Ａ，只會與另一條 DNA 上的鹼基Ｔ配對，鹼基Ｃ只會與鹼基Ｇ配對，因此 DNA 雙股是互補的關係。 生物體內的遺傳訊息均儲存在 DNA 分子中，細胞藉著轉錄過程，將儲存在 DNA 中的遺傳訊息轉成 mRNA，mRNA 再利用轉譯過程，製造出相關的蛋白質。而在生物細胞中，蛋白質才是最終具有生化反應及新陳代謝功能的分子。 他們做出一個單一的核酸片段，有12個氮鹼基股，和來自人p53基因的互補副本。這段DNA具有原先12個基礎股上一樣的密碼，不過因為它被染色的非常光鮮明亮，容易定序。 傳統上，的DNA定序，常使用「Capillary Array Electrophoresis」毛細管排列電泳（CAE），將核酸截成無數碎片，再拼湊而成，這種技術需要使用非常複雜的軟體才能夠操作。 這方法雖然可行，是此技術通常需要昂貴的設備和試劑，但是當含有大量的DNA雙股，將近384個時需要一次全部定序，這需要更快更便宜的方法。 傑弗?施洛斯說：「我們已經竭盡所能供應CAE所有的花費」。他是在Bethesda，美國，馬利蘭的全國人類基因組研究所(NHGRI)工作。 四、氮鹼基之間的相互接觸 ： 另外一種市售的定序替代選擇是pyrosequencing，這可能會導致錯誤發生，因為把單個氮鹼基和緊密接觸著彼此的相似的氮鹼基要分別是很困難的。這是一個遺傳學家伊蓮恩Mardi所說的話，他是在美國聖路易士的華盛頓大學工作。 相反的，被Ju修飾過的核酸可以被更準確地完成，因為裡面包含一種阻礙體（blocker），每次指允許一種核甘酸被偵測r。一但它的顏色已經被發現並且有記錄，鐳射光會將之分割，染劑和blocker就會分別離開，然後依序加入下一核甘酸中。 五、結論