第4章生化(刘建华)题材.ppt

Biochemistry Sixth Edition;这个母亲和她的两个女儿基因相同，所以她们长得很相像。基因必须表达后才能执行其功能。蛋白质调节基因的表达。锌指纹蛋白是一个调节基因表达的蛋白质。该蛋白质（用绿色球表示锌；用红色表示蛋白质）能够与相应的DNA区域(黑色）结合。这段DNA区域就是基因表达的调控区域 [(left)Barnaby Hall/Photonica. (right) Drawn from 1AAY.pdb]。;;图4.1 核酸的聚合物结构。;图4.2 核糖和脱氧核糖。糖单位的院子用阿拉伯数字加“ ’ ”表示，以区别于碱基原子的序号（图4.4）。;图4.3 DNA和RNA的骨架。核酸骨架用3’-到5’-的磷酸二酯键连接。其中一个糖单位用红色强调，一个磷酸基用蓝色强调。;图4.4 嘌呤和嘧啶。碱基原子的编号不加“ ’ ”。RNA分子用尿嘧啶替代DNA的胸腺嘧啶。;图4.5 核苷的糖苷键是b-型。;图4.6 腺嘌呤核苷5’-三磷酸（ATP）和脱氧鸟嘌呤核苷3’-磷酸（3’-dGMP）。;缩写pApCpG或pACG表示一个三核苷酸DNA，是用磷酸二脂键连接的脱氧腺苷单磷酸、脱氧胞苷单磷酸、和脱氧鸟苷单磷酸。p表示一个磷酸基团（图4.7）。5-端有一个磷酸基团与核糖5-OH结合。注意，核酸与多肽链一样有极性。因此，ACG和GCA是两种不同的化合物。;大肠杆菌基因组只有一个DNA双链，每条链的长度是460万核苷酸（图4.8）。;已知DNA最长的生物是印度muntjak（亚洲鹿），其基因组长度与人基因组长度相当，但只有3种染色体，其中最长的染色体长度含有10亿多个核苷酸。如果将这种DNA分子完全伸展，其长度将超过1英尺。有些植物染色体含有更长的DNA分子。;在确定DNA三维结构的过程中发现碱基特异性配对。Maurice Wilkins和Rosalind Franklin获得了DNA纤维的x-光衍射图谱（图4.10）。该衍射图谱说明DNA是两条链缠绕形成规则的螺旋结构。从这些数据及其他数据，James Watson 和Francis Crick推测DNA具有双螺旋结构，这种双螺旋结构与核酸的功能相吻合。;James Watson 和Francis Crick从x-光衍射图谱推测的DNA双螺旋结构具有下列特征： 1. 两条核酸链方向相反，围绕同一轴缠绕形成螺旋结构。 2. 糖-磷酸骨架在双螺旋外侧，碱基处于双螺旋内部。 3. 碱基几乎与双螺旋轴垂直，相邻碱基间的距离是3.4A。这种间???在x-光衍射图谱（图4.10）中可以看出。一个螺旋结构重复是34A，10个碱基。因此每个碱基旋转36o。 4. 螺旋的直径是20A。;图4.11 Watson-Crick的DNA双螺旋结构模型。一条多核苷酸连用蓝色表示，另一条多核苷酸连用红色表示。嘌呤和嘧啶碱基用较浅的颜色表示，糖磷酸骨架的颜色较深。（A）轴向观测图。沿螺旋轴（垂直方向）每隔34A（即一条链的10个核苷酸）就出现一次重复。（B）星形观测图，沿螺旋的纵轴朝里面观察。;鸟嘌呤与胞嘧啶配对和腺嘌呤与胸腺嘧啶配对的形状几乎相同（图4.12）。;碱基配对能够解释Erwin Chargaff在1950年观察的现象，即所有DNA分子中腺嘌呤与胸腺嘧啶的比例和鸟嘌呤与胞嘧啶的比例几乎相同，而腺嘌呤与鸟嘌呤的比值在不同物种中差异很大（表4.1）。;在双螺旋内部，一层碱基对堆积在另一层碱基对上。碱基堆积作用包括（1）疏水效应稳定了DNA双螺旋结构。疏水碱基聚集于双螺旋内部（避开DNA的水环境），而双螺旋表面更亲水。 （2）疏水效应使碱基堆积于另一个碱基之上，一对碱基的范德华力达2 ~ 4 kJ/mol （0.5 ~ 1 kcal/mol），跟多碱基堆积产生的总和非常显著。 此外DNA分子骨架的刚性五元环糖基结构也有利于碱基堆积。;半保留复制;1958年Mathew Meselson和 Franklin Stahl的试验验证了这个假说。;实验解释。;核酸堆积碱基所吸收的紫外光比非堆积碱基所吸收的紫外光弱，这种效应叫减色效应（hypochromism)。因此，核酸熔化的检测就很简单，只是测定紫外吸收值。核酸的最大吸收峰在260 nm波长处（图4.17）。;核酸堆积碱基所吸收的紫外光比非堆积碱基所吸收的紫外光弱，这种效应叫减色效应（hypochromism)。因此，核酸熔化的检测就很简单，只是测定紫外吸收值。核酸的最大吸收峰在260 nm波长处（图4.17）。;图4.18 线粒体环状DNA的电镜图谱。（A）松弛的环状DNA。(B) 超螺旋环状DNA。封闭的DNA分子就是环状DNA。双螺旋DNA的轴进一步扭曲缠绕形成超螺旋（图4.18B）。超螺旋具有重要的生物学意义，原因是（1）超螺旋使DNA分子压