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 PAGE \* MERGEFORMAT 5 概念 生物信息学 狭义：分子生物信息学，用信息技术存储、分析基因组、蛋白质组序列。 广义：指生物科学与信息科学与计算机科学、物理学、化学交汇融合的交叉学科。 信息：指能够消除人们不确定性的东西 。信息可以计算 Score：衡量匹配结果的质量，是相对的（与选取的计分依据有关），越高越好 E值：expectation value 评估相似性，是绝对的，越低越好 P值：P 0 表示越显著结果越可信， P ∞ 结果随机产生的可能性越大） 是指获得至少与两条无关序列间的偶然相似性一样高的分值的概率，低P值表明重要的匹配，这些匹配可能会有生物学意义 重复序列：真核生物的基因组中具有多数反复存在的DNA 顺序组成（一般不参与编码） 用Repeatmasker软件查找重复序列 序列谱：由多序列对比结果的全部信息构造的序列特征表,表中列出每一个位点氨基酸残基的替代.插入,缺失等情况 双序列比对：通过一定的算法对两个DNA或蛋白质的序列进行比较，找出两者之间最大相似性的方法。 工具是用程序来编写完成算法。 记分矩阵：为了反映两个序列比对结果而预先设定的分值矩阵。 取代矩阵：PAM、BLOSUM 稀疏矩阵：只有相同的为1，其余的为0，大多数矩阵单元的值为0。 DP(动态规划)：按某种条件舍去那些不可能