ETphantom软件使用说明.doc

ETphantom软件使用说明 软件安装所需环境： Opencv，Qt4（qt5不可用）以及Imod（已在64位ubuntu系统，安装有opencv2.4.9，qt4.7.4以及imod的环境下测试可用。） ETphantom软件第一次使用时需要选择工程存储的默认路径（不更改则默认在/home/user/tomo_project下)。新创建一个项目时，点击菜单栏或者工具栏内的NewProject选项，在弹出的对话框中，选择我们提供的phantom文件，输入工程名，点击创建即可创建一个新的工程。 创建新工程 打开已有工程，可以点击OpenProject选项，选择所在工程的.pro文件，即可打开已有工程。点击SetProjectPath按钮可以更改工程存储的默认路径。视图右侧为当前工程下的所有文件，文本文件可以直接打开进行查看，图像文件需要使用imod进行查看。 对于拥有图像视图的模块中，左边的图像为需要进行处理的图像，右边的图像为处理后的图像。对于拥有Thread Num输入栏的模块需要在输入框内输入可以使用的线程数目。 ETphantom的基本处理流程如下： 1.3D Volume Construct 模块 该部分包括Normalize、Warp和Marker三个部分： Normalize： 参数：旋转角度（整数） 在Normalize中，可以实现图像的旋转功能，输入需要旋转的角度，点击start按钮便可进行旋转。 Normalize模块 Rotate Angle:0 Warp： 该部分包括三个处理过程：extend、xy平面的弯曲模拟（warpXY）以及z轴方向的弯曲模拟（warpZ）。 1）Extend： 参数：extend类型 为了防止在后续的步骤中丢失有效的信息，需要在初始时对图像做扩展处理。在Extend中，可以实现图像的xy平面扩展，扩展后的图像为原始图像的三倍。此处共有两种扩展方式：mean和mirror。Mean方式选择使用图像的平均值填充图像的扩展部分，mirror方式选择使用轴对称的方式填充图像的扩展部分。 2）Warp： 在Warp的处理中，首先需要进行模式的选择，目前有两种模式可选：normal以及nowarp。Normal模式可以填入的参数如图中所示。 Normal模式：该模式可以进行正常的warpXY以及warpZ处理，参数可由用户选填。 Nowarp模式：该模式不进行warpXY处理，且warpZ的除角度外所有参数都为0，并且最后只生成一张一个角度的图片。 warpXY： 参数：开始角度，结束角度，角度间隔，指定角度，σ和 在warpXY中，填入角度的前三个参数（eg：60，-60，2）以及σ和参数（代表弯曲程度），可以进行其中每个角度的warpXY处理，warpXY完成后会生成与phantom图片相同张数的各个角度（eg：-60~+60）的warpXY图像。如果输入了指定角度，则会只生成一张该角度的warpXY图像。 warpZ： 参数：开始角度，结束角度，角度间隔，指定角度，σ和和α 在warpZ中，填入角度的前三个参数（eg：60，-60，2）以及σ和和α（代表弯曲程度）参数，可以进行其中每个角度的warpZ处理，warpZ完成后会生成与phantom图片相同张数的各个角度（eg：-60~+60）的warpZ图像。如果输入了指定角度，则会只生成一张该角度的warpXY图像。 Warp模块 Extend type:mean , Warp Mode:Nomal start?angle:-60 , end angle:60 , angular sampling interval:2 specified?angle:null , σ:0.1 , τ:0.1 start?angle:-60 , end angle:60 , angular sampling interval:2 specified?angle:null , σ:0.1,τ:0.1 , α:0.002 3）Marker： 参数：Marker Type（marker类型），Number（marker点数量），Bottom size（上表面marker点size），Top size（下表面marker点size），Noise（噪声），MarkerA和a（两个marker参数） Marker模块 Marker Type:Gaussian , Number:100 , Bottom size:3 , Top size:2 Noise:0, Marker A:0.1 , a:0.2 在Marker中，可以实现人工添加Marker点，并可以设置所添加Marker