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3 蛋白质与氨基酸. 第三章
;一、蛋白质的分类 ;(二)根据组成和溶解度;(5) 组蛋白(histone):溶于水及稀酸溶液,分子中含Arg、Lys
较多,呈(弱)碱性,如小牛胸腺组蛋白。 ;2.缀合蛋白质(conjugated protein):也称结合蛋白质,
由蛋白质和非蛋白质两部分组成。 ;名称;1.活性蛋白质(active protein) ;二、蛋白质功能的多样性;三、蛋白质构象和蛋白质结构的组织层次; 为了对蛋白质结构叙述的方便,人为地将蛋白质的结构分为一级结构、二级结构、三级结构和四级结构。 ; 随着蛋白质化学研究的进展,越来越多的人认为在二级结构和三级结构之间应加入超二级结构和结构域这两个层次,所以蛋白质的结构层次为:;;四、蛋白质的化学组成 ;化学组成 ; 蛋白质水解:用H+,OH-或酶将蛋白质彻底水解,可以得到许多种氨基酸的混合物,说明氨基酸是蛋白质的基本结构单位。 ;;第二节
蛋白质的基本结构单位
——氨基酸(amino acid, aa或AA) ;2、氨基酸的分类、结构、代号 ;(2) 按侧链R基的极性;中性氨基酸;;;;;;;二、氨基酸的构型、旋光性和光吸收 ;以丙氨酸为例:; 如含两个手性碳原子,则有4种立体异构体,分别称为D-,L-,D别-和L别-氨基酸。 ;旋光性:;;光吸收:;;三、氨基酸的酸碱性质和等电点 ;2、氨基酸的两性解离和等电点 ; 氨基酸在水中的两性离子既能像酸一样放出质子,也能像碱一样接受质子,氨基酸具有酸碱性质,是一类两性电解质。;不同pH时氨基酸以不同的离子化形式存在: ; 实验证明在等电点时,氨基酸主要以两性离子形式存在,但也有少量的而且数量相等的正、负离子形式,还有极少量的中性分子。 ;3.氨基酸的酸碱滴定曲线 ;;;4.等电点的计算 ;酸性氨基酸,以Asp为例:;碱性氨基酸,以Lys为例:;氨基酸的甲醛滴定 ;; 四、氨基酸的化学性质 ;(1)与HNO2的反应;(2)酰基化反应 ;Cbz-Cl;氨基酸与 5一二甲氨基萘-1-磺酰氯(dansyl chloride,DNS)的反应 ;(3)烃基化反应(测N-末端氨基酸) ;DNFB;② 与苯异硫氰酸(酯)的反应(Edman 反应) ;2.α-羧基参加的反应 ;酰化氨基酸;(2)成酰氯反应 ;(3)成酰胺反应 ;(4)脱羧基反应 ;(5)叠氮反应 ;3. α-氨基和α-羧基共同参加的反应 ;(2)成肽键 ;4.侧链R基参加的反应 ; 半胱氨酸的-SH很活泼,很容易在空气中重新氧化形成二硫键,一般可用卤代化物对-SH进行保护。 ;(2)苯环的黄色反应 ;(3)酚基的Millon反应(米伦氏反应) ;(4)pauly反应 ;(5)Folin一酚反应 ;氨基酸化学性质总结(重点) ; 五、氨基酸分析 ;(1)逆流分溶(逆流分配) ;;(2)纸层析 ;双向纸层析图 ;(3)薄层层析 ;2.离子交换层析法 ;离子交换树脂: ;阳离子交换树脂:活性基团是酸性的,如磺酸基-SO3H
(强酸型),羧基-COOH(弱酸型);;X+;;第三节 肽(peptide) ;氨基酸之间通过肽键连接形成的链称肽链。 ;命名:根据氨基酸组成,由N端→C端命名 ;;;;;; 二、肽的理化性质 ;肽的等电点:肽所带净电荷为“零”时,溶液的pH值。 ;2.肽的化学性质 ; 三、天然存在的某些活性肽 ;2.谷胱甘肽(glutathione,GSH) ;3.多肽抗菌素 ;4.多肽激素 ;5.神经肽 ;第四节 蛋白质一级结构及一级结构分析;(一)蛋白质的一级结构(primary structure) ;2.蛋白质一级结构的测定 ;;序列测定方法 ;② 丹磺酰氯法(DNS法) ;③ 苯异硫氰酸(酯)法(PITC法、PTC法、PTH法、Edman降解法 ) ;④ 氨肽酶(aminopeptidase, Apase)法 ;亮氨酸氨肽酶(Leucine amino peptidase, LAP);N端氨基封闭的几种情况 :;C端分析 ;② 肼解法:也称联氨法 ;③ 羧肽酶(carboxypeptidase, Cpase)法 ;4种羧肽酶的来源和专一性 ;(2)肽链的拆开和分离 ;;(3)氨基酸组成的分析 ;(4)肽链的部分水解 ;;酶解方法 ;(5)肽段的分离和氨基酸序列测定 ;(6)找重叠肽从而推断整个肽链的氨基酸序列 ;(7)二硫键位置的确定 ;3.蛋白质测序举例 ;; 近年来由于DNA序列的测定发展很快,可将相应于蛋白质的DNA序列测定出来后,推出蛋白质的序列,为蛋白质一级结构的测定带来了新的曙光。 ;4.蛋白质序列数据库 ;(二)肽的人工合成;2.合成方法 ;氨基保护基Y:Cbz、Boc、T
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