- 1、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。。
- 2、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
- 4、该文档为VIP文档,如果想要下载,成为VIP会员后,下载免费。
- 5、成为VIP后,下载本文档将扣除1次下载权益。下载后,不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
- 6、成为VIP后,您将拥有八大权益,权益包括:VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
- 7、VIP文档为合作方或网友上传,每下载1次, 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等,对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
查看更多
系统进化树构的建方法与软件应用
系统进化树的构建方法与软件应用;什么是系统进化树;直系同源和旁系同源;系统进化树的分类;有根树和无根树的进化层面上的意义;系统进化树的结构;系统进化树的结构;构建系统进化树的理论方法;构建系统进化树的理论方法;构建系统进化树的理论方法;构建系统进化树的所涉及的工具;构建系统进化树的所涉及的工具;构建系统进化树的所涉及的工具;构建NJ树,可以用PHYLIP或者MEGA
构建MP树,可以使用PHYLIP或者MEGA
构建ML树可以使用PHYML,速度快,同时构建ML树还可以用PHYLIP,或者可以使用BioEdit
贝叶斯的算法以MrBayes为代表,不过速度比较慢
关于系统发育分析的更多知识请参阅:
/biology/bioinfo2/78842.shtml;构建系统进化树的主要步骤;构建系统进化树的主要步骤;实例讲解; 构建我们自己的Fasta 文件;实例讲解;实例讲解;实例讲解;实例讲解;实例讲解;实例讲解;实例讲解;实例讲解;实例讲解;实例讲解;实例讲解;实例讲解;实例讲解;实例讲解;实例讲解;实例讲解;进化树评估优化方法简介:常用的两种方法就是Bootstrap和Jackknife。? ?? ???所谓Bootstraping法 就是从整个序列的碱基(氨基酸)中任意选取一半,剩下的一半序列随机补齐组成一个新的序列。这样,一个序列就可以变成了许多序列,一个多序列组也就可以变 成许多个多序列组。根据某种算法(最大简约性法、最大可能性法、邻位相连法)每个多序列组都可以生成一个进化树。将生成的许多进化树进行比 较,按照多数规则(majority-rule)我们就会得到一个最“逼真”的进化树。其数值反应了该树枝的可信的百分比。 所谓Jackknife则是另外一种随机选取序列的方法。它与Bootstrap法的区别是不将剩下的一半序列补齐,只生成一个缩短了一半的新序列。
Double Check
通常情况下当我们用建树的一种方法获得了树图之后,我们建议大家可以通过另外的方法建树,如果先后的两个树图大体一致,我们认为之前构建的树是相对可靠的。;Thanks
您可能关注的文档
最近下载
- 2025年院感知识理论考试题库+答案.docx VIP
- 配合协调与服务承诺.docx VIP
- 14《称空气》课件 科学三年级上册(苏教版2025).pptx
- 晚期消化道肿瘤临床规范诊疗新进展题库答案-2025年华医网继续教育.docx VIP
- 工程协调配合措施及承诺.docx VIP
- 医院信息科笔试、面试题(附答案).docx VIP
- 施工协调配合的承诺与措施.pdf VIP
- 医院信息科计算机考试精彩试题(附答案).docx
- 2025年最新人教版七年级(初一)数学上册教学计划及进度表(新课标,新教材).docx
- 2025至2030地毯和室内装饰清洁服务行业项目调研及市场前景预测评估报告.docx
文档评论(0)